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落基山脉花栗鼠多样化_基因渐渗与核质不一致数据集
数据集概述 本数据集聚焦北美落基山脉及大盆地的花栗鼠（Tamias quadrivittatus群），通过靶向外显子捕获技术获取数千个核基因座及完整线粒体基因组数据，分析物种间基因渐渗模式与核质遗传不一致现象，为理解该类群进化历史提供基础数据。 文件详解 补充图表文件：...
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CAD在冈瓦纳大陆分裂事件恢复及水甲虫亚科Aciliini进化史研究数据集
数据集概述 本数据集围绕水甲虫亚科Aciliini的系统发育分析展开，包含基于8个基因片段（含CAD基因）的研究结果，验证了Aciliini的单系性、与Eretini的姐妹群关系，探讨了冈瓦纳大陆分裂对其生物地理分布的影响，并评估了CAD基因在系统发育研究中的效用。 文件详解 该数据集包含4个文件，具体说明如下： - 表格文件（PDF格式）： -...
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鸟类系统发育基因组数据类型与分类单元采样影响研究数据集
数据集概述 本数据集围绕鸟类系统发育基因组学研究展开，聚焦新鸟亚纲早期分化节点的系统发育树冲突问题，通过构建含90%非编码序列的235种鸟类数据矩阵，对比分析数据类型、分类单元数量及位点数量对系统发育树拓扑结构的影响，揭示数据类型为导致树结构不一致的关键因素。 文件详解 压缩文件（.gz格式）：...
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淡水藻类Synura复杂系统地理模式数据集
数据集概述 本数据集围绕淡水藻类Synura的复杂系统地理模式展开，通过多基因串联数据研究其全球分布特征，探讨微生物真核生物的广布性与特有性并存现象。数据包含基因序列文件及说明文档，为理解淡水微藻的生物地理学机制提供支撑。 文件详解...
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豆科植物古多倍体系统发育基因组与白垩纪_古近纪灭绝事件关联数据集
数据集概述 本数据集围绕豆科植物起源与早期演化展开，聚焦其古多倍体事件与白垩纪-古近纪（K-Pg）大灭绝事件的关联。通过基因树 reconciliation、基因计数数据及系统发育超网络重建等方法，结合36个核基因的时钟模型与20个化石校准点，分析豆科植物全基因组复制（WGD）事件的时间线，为理解新生代生物多样性起源提供数据支持。 文件详解...
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蝴蝶分化时间贝叶斯分析先验与后验数据集
数据集概述 本数据集为Chazot等人2018年关于蝴蝶分化时间贝叶斯分析的研究数据，包含分类单元列表、分子矩阵、不同分析条件下生成的时间校准树等内容，支持蝴蝶演化时间研究的复现与扩展分析。 文件详解 分类单元与基因信息文件： S_1_List_of_taxa.xlsx：Excel格式，包含研究涉及的分类单元名称及对应的Genbank登录号...
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Loxandrina属级分类单元系统发育与分类数据集
数据集概述 该数据集围绕鞘翅目步甲科Abacetini族Loxandrina亚族的属级分类单元展开，包含分子与形态数据的系统发育分析结果及分类学修订信息，为理解该类群的演化关系与分类体系提供数据支持。 文件详解 系统发育分析文件: TNT-2019.12.17-Run.1.zip: 压缩文件，可能包含TNT软件的系统发育分析运行结果 Lox-...
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家猫乙型肝炎病毒的古老起源与全球传播补充数据集
数据集概述 本数据集是论文《家猫乙型肝炎病毒的古老起源与全球传播》的补充数据，包含支持共进化分析、假设检验及高通量测序的原始数据，为研究家猫乙肝病毒的进化历史与传播路径提供基础资料。 文件详解 共进化分析文件（NEXUS格式）： CytBnt.nex：NEXUS格式文件，用于宿主与嗜肝病毒的序列比对及共进化分析...
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珊瑚礁鱼类扩散能力与种群遗传结构及物种丰富度关联数据集
数据集概述 本数据集围绕珊瑚礁鱼类扩散能力展开，涵盖其种群遗传结构与物种丰富度的关联数据。通过对比底栖护卵型和浮游产卵型两种繁殖策略鱼类的基因流、种群分化及物种多样性差异，为揭示微进化与宏进化过程的连续性提供数据支持。 文件详解 系统发育树文件：...
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南极晚白垩世甲龙类体甲功能与演化数据集
数据集概述 本数据集围绕南极晚白垩世新发现甲龙类标本，结合骨组织学与形态测量学方法，探究甲龙类体甲的功能与演化。数据包含系统发育分析文件、体甲数据集、补充图表等，为研究高纬度环境中甲龙类体甲的结构适应性及演化提供支持。 文件详解 说明文档: README.md: Markdown格式文档，包含数据集作者信息、补充材料与方法说明、文件清单及描述等内容。...
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地下甲壳类动物功能差异与营养级进化关联数据集
数据集概述 本数据集包含支持“地下甲壳类动物高营养级的环境依赖型进化驱动功能差异”研究的核心数据与分析代码，涉及形态学数据、系统发育树及可复现分析流程的文件，为相关进化与功能生态学研究提供数据基础。 文件详解 Niphargus_morpho_data.xlsx：Excel格式形态学数据文件，用于导入R语言进行分析...
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北美树花属_梅衣科_分子研究数据集
数据集概述 本数据集聚焦北美树花属（Alectoria）地衣的分子系统发育研究，通过ITS和Mcm7两个核基因分析9个类群的48个样本，探讨5个与A. sarmentosa相关或易混淆类群的分类界限，提出临时分类处理建议及新物种组合，并提供北美树花属物种检索表。 文件详解...
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鸟类疟疾寄生虫的进化关系_协同物种形成与宿主转换数据集
数据集概述 本数据集围绕鸟类疟疾寄生虫与宿主的协同进化关系展开，通过细胞色素b序列的系统发育分析，探究寄生虫的宿主分布、协同物种形成事件及宿主转换过程，为理解宿主-寄生虫关系的结构机制提供数据支持。 文件详解 文件名称：Ricklefs_Coevolution.nex 文件格式：NEXUS格式（.nex）...
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加勒比地区广泛分布的安乐蜥群岛遗传学数据集
数据集概述 本数据集聚焦加勒比地区波多黎各堤岸（含美属、英属、西班牙属维尔京群岛）广泛分布的波多黎各冠安乐蜥（Anolis cristatellus），通过核DNA、线粒体DNA序列及微卫星基因型数据，探究海平面波动对其种内遗传多样性与分化的影响，对比隔离与连通性场景下的遗传分化模式。 文件详解...
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外生菌根真菌ITS多序列比对补充材料
数据集概述 本数据集为研究外生菌根真菌核核糖体内部转录间隔区1（ITS1）中信号识别颗粒（SRP）RNA检测的补充材料，包含63条匹配ITS序列及3条新生成序列的多序列比对文件，采用NEXUS格式存储，用于展示序列结构组成。 文件详解 文件名称: oo_88586.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件内容:...
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离散特征矩阵不相似性度量及差异研究数据集
数据集概述 本数据集围绕离散特征矩阵的不相似性度量展开，包含用于差异研究的新度量方法相关代码、实验数据及附录文档，旨在解决含不适用特征的矩阵在差异分析中常见的距离排序问题，支持宏观进化推断研究。 文件详解 dissimilarity_functions.R：R语言代码文件，包含新提出的不相似性度量函数实现，用于计算改进后的特征矩阵不相似性。...
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当代生态互作与蛾类口器长度演化模型数据集
数据集概述 本数据集围绕天蛾与植物的传粉互作关系，研究当代生态互作如何影响天蛾口器长度的演化过程。通过改进Ornstein-Uhlenbeck模型，分析植物花冠深度与天蛾口器长度的关联，为理解生态互作在性状演化中的作用提供数据支持。 文件详解 文件名称:...
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真蛙属时空多样化研究数据集
数据集概述 该数据集围绕真蛙属（Rana）的时空多样化展开，包含基于核基因与线粒体基因序列构建的系统发育树及相关补充材料，支持“走出亚洲”的扩散模式、新旧大陆分化轨迹等进化历史研究，为模型生物真蛙属的比较分析提供基础。 文件详解 文件名称:...
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跨安第斯地区Rhamdia属鱼类分类修订的遗传与形态测量数据集
数据集概述 本数据集围绕跨安第斯地区Rhamdia属鱼类分类修订展开，包含支持重新识别多个曾被同义化物种的遗传与形态测量数据，为该属鱼类分类学研究提供实证支持。 文件详解 系统发育分析文件： RhamdiaCOLMay117.nxs：NEXUS格式文件，可能包含用于系统发育分析的原始数据...
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鸡形目鸟类分子遗传时间尺度与多样化速率分析数据集
数据集概述 本数据集基于线粒体与核DNA序列数据，通过贝叶斯系统发育推断构建鸡形目225种现存物种的时间校准分子系统发育树，探讨其白垩纪起源、白垩纪-古近纪灭绝事件后的幸存支系及多样化速率变化模式。 文件详解 说明文档（PDF格式）： README_for_Stein et al 2015 - BEAST xml file for taxon-...
