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MD_Based_DPPC_Berger_OPLS06_NaCl_1Mol_scaled_双层膜动力学完整数据
2025年12月21日 30 10 1
数据集概述 本数据集包含完全水合的DPPC双层膜与1摩尔氯化钠的分子动力学(MD)模拟轨迹及相关文件,采用OPLS-AA兼容的Berger-DPPC-06力场,模拟条件为323K,含72个脂质、2778个SPC水分子及51对钠氯离,轨迹时长120纳秒。 文件详解 模拟核心文件:...
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蛋白质空腔与水动力学识别表征工具教程文件_CICLOPv2
2025年12月19日 30 202 64
数据集概述 本数据集是CICLOP v2.0工具的教程文件,该工具用于识别和表征蛋白质空腔及其中的水。数据集包含工具代码、示例文件、环境配置文件和教程文档,为使用该Python工具分析分子动力学轨迹或PDB文件提供支持。 文件详解 工具代码文件: CICLOPv2.0_waterdynamics.py: Python格式,CICLOP...
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DPPC_Berger_OPLS06_Based_盐环境下DPPC双层膜分子动力学完整数据
2025年12月14日 30 131 88
数据集概述 本数据集包含完全水合的DPPC双层膜在1摩尔氯化钠环境下的分子动力学模拟轨迹及相关文件,采用OPLSAA兼容的Berger-DPPC-06力场,模拟时长120纳秒,分析了最后60纳秒的数据,为研究DPPC膜在盐环境中的结构与动力学提供支持。 文件详解 模拟配置与力场文件:...
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DMPC双分子层Gromos_53A6_Berger脂质200纳秒模拟数据集
2025年12月14日 30 180 100
数据集概述 本数据集包含DMPC双分子层的200纳秒分子动力学模拟数据,采用Gromos 53A6力场与Berger脂质参数构建,系统含128个DMPC脂质与3655个SPC水分子,共16853个原子,模拟前已平衡52纳秒,提供脂质面积与厚度分析结果。 文件详解 模拟配置与参数文件: dmpc.itp:ITP格式,脂质拓扑参数文件 npt-...
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嵌套压缩分子动力学模拟测试数据集
2025年12月11日 30 69 6
数据集概述 该数据集为嵌套压缩文件测试数据,包含分子动力学模拟(MD)的轨迹文件(XTC格式)和拓扑文件(TPR格式),用于验证代码对嵌套压缩文件结构的处理能力。 文件详解 文件名称: outerzip.zip 文件格式: .zip(压缩文件) 内部嵌套结构及内容: 轨迹文件:...
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胆固醇对膜影响的非普遍性研究数据集
2025年12月7日 30 78 54
数据集概述 本数据集包含原子分子动力学模拟的设置文件、参数文件及后处理分析用的修改轨迹,围绕胆固醇对膜的流动性、曲率感知和弹性的非普遍性影响展开,对应2023年发表于《Nature Comm.》的研究。 文件详解 压缩文件: Membrane-...
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Peter_Tieleman_DPPC_Berger_NaCl_Based_1molNaCl下DPPC双层膜MD模拟完整数据
2025年12月6日 30 196 58
数据集概述 该数据集包含1摩尔氯化钠(NaCl)环境下完全水合DPPC双层膜的分子动力学(MD)模拟轨迹及相关文件。采用Berger-DPPC-98力场和Gromos离子力场,模拟条件为323K、72个脂质分子、2778个SPC水分子及51对Na/Cl离子,轨迹时长120纳秒,分析使用最后60纳秒数据。 文件详解 分子动力学参数与拓扑文件:...
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DPPC_Berger_NaCl_scaled分子动力学模拟数据集
2025年12月6日 30 16 15
数据集概述 该数据集包含150mM氯化钠溶液中完全水合的DPPC双层膜的分子动力学模拟轨迹及相关文件。使用Peter Tieleman提供的Berger-DPPC-98力场与Gromacs...
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Gromacs_DPPC_Berger_OPLS06_NaCl_Based_盐溶液中DPPC双层膜120ns模拟完整数据
2025年12月6日 30 184 136
数据集概述 本数据集包含150mM NaCl溶液中完全水合DPPC双层膜的分子动力学(MD)模拟轨迹及相关文件,采用Berger-DPPC-06力场与Gromacs 4.6.7生成,离子电荷缩放系数为0.7,提供120ns模拟数据及后60ns分析结果。 文件详解 模拟轨迹文件: md.xtc: 轨迹文件,存储120ns模拟的原子坐标信息...
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PeterTielemanLab_DPPC_Berger_NaCl_1Mol_Based_盐环境下DPPC双层膜动力学完整数据
2025年12月6日 30 152 117
数据集概述 本数据集包含完全水合的DPPC双层膜在1摩尔氯化钠环境下的分子动力学模拟轨迹及相关文件,基于Berger-DPPC-98力场和Gromacs 5.0.4软件生成,离子电荷缩放系数为0.7,模拟时长120纳秒。 文件详解 分子动力学模拟文件: md.gro:GROMACS结构文件,存储模拟系统的原子坐标与拓扑信息...
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学术论文查重结果评估数据集AcademicPaperPlagiarismDetectionResultsEvaluation-azharabdulaziz
2025年5月1日 30 100 10
学术论文查重结果评估数据集AcademicPaperPlagiarismDetectionResultsEvaluation-azharabdulaziz 数据来源:互联网公开数据 标签:学术论文, 查重, 抄袭检测, 评估, 性能指标, TPR, FPR, F1值, 数据分析 数据概述:...



