找到168个数据集

标签: VCF

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  • WBPH_2b_RAD_Based_大湄公河次区域迁入中国北方白背飞虱基因测序数据

    2026年1月15日   

    数据集概述 本数据集通过2b-RAD测序技术,分析了大湄公河次区域(GMS)白背飞虱(WBPH)迁入中国北方的种群遗传结构。包含18个山东站点及6个GMS区域的样本基因数据,揭示了迁入来源、遗传多样性及种群聚类特征,为明确白背飞虱迁移路线及来源提供支撑。 文件详解 基因测序结果文件...
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  • CNVkit_Based_RD_Connect_GPAP合成数据拷贝数变异检测数据

    2026年1月15日   

    数据集概述 本数据集是从Zenodo原始BAM文件集合中提取的子集,基于RD-Connect GPAP合成数据进行处理,通过CNVkit检测拷贝数变异,仅保留感兴趣区域。数据集包含72个文件,涵盖.cns、.vcf、.json三种格式,聚焦于基因组拷贝数变异的分析研究。 文件详解 文件类型与分布...
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  • Alvarado_Serrano_Based_紫茉莉入侵杂草连通性影响因素研究数据

    2026年1月15日   

    数据集概述 本数据集聚焦入侵杂草紫茉莉(Ipomoea purpurea)的种群遗传结构与连通性,包含其SNP、SSR分子标记数据及景观变量数据,用于分析自然景观与人为因素对该物种基因流的影响,助力理解入侵物种扩散机制与管理策略制定。 文件详解 文档类文件(.txt格式) README_for_Alvarado-Serrano et...
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  • Quercus_rugosa_Landscape_墨西哥高山栎气候相关遗传变异数据

    2026年1月15日   

    数据集概述 本数据集围绕墨西哥高山栎(Quercus rugosa)种群的气候适应性遗传变异展开,通过基因分型测序获取17个采样点103个个体的5354个单核苷酸多态性(SNPs)数据,结合梯度森林模型分析遗传变异与气候因子的关联,识别气候适应相关基因位点,为该物种的气候适应研究及保护管理提供数据支持。 文件详解...
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  • Passer_domesticus_Based_肯尼亚麻雀范围扩张表观遗传研究数据

    2026年1月14日   

    数据集概述 本数据集围绕肯尼亚家麻雀约七十年范围扩张过程中的表观遗传潜力展开研究,包含五个区域的CpG位点数量及DNA甲基化数据。核心探索CpG位点数量在扩张前沿与核心区域的分布差异,分析其是否受选择驱动,以及DNA甲基化在扩张中的变化规律,为表观遗传机制推动物种扩张提供数据支撑。 文件详解...
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  • 波罗等人基于绿海葵_Anemonia_viridis_共生菌获取遗传数据_补充资料

    2026年1月14日   

    数据集概述 本数据集为Porro et al.关于地中海蛇锁海葵(Anemonia viridis)共生菌水平获取机制研究的补充数据,包含宿主动物单核苷酸多态性(SNPs)数据、共生菌ITS2序列数据及共生菌组成表格,用于分析宿主与共生菌群落的关联模式及水平获取能力。 文件详解 README.txt 文件格式:TXT...
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  • Rana_pipiens_Based_草原坑洼区豹蛙遗传连通性与景观因子关联研究数据

    2026年1月14日   

    数据集概述 本数据集围绕草原坑洼区北部豹蛙(Rana pipiens)的遗传连通性展开,通过景观遗传学分析探究土地利用与地形对其种群遗传分化的影响。包含22个采样点的SNP基因分型数据、10类景观变量的栅格数据及连通性建模结果,共33个文件,为两栖动物保护及栖息地管理提供科学依据。 文件详解 栅格数据文件...
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  • Raeymaekers_NatCommun_2017_三刺与九刺棘鱼适应性分化研究数据

    2026年1月14日   

    数据集概述 本数据集包含三刺和九刺棘鱼的基因分型及相关研究数据,用于分析两种亲缘关系相近的鱼类在共同生境中沿盐度梯度的中性与适应性分化差异。数据支撑对物种特异性适应能力、表型平行性与基因组非平行适应性的研究,共含3个文件。 文件详解 九刺棘鱼基因分型文件 文件名称:Raeymaekers et al-...
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  • Peromyscus_leucopus_Based_白足鼠城市与农村种群转录组资源数据

    2026年1月13日   

    数据集概述 本数据集为白足鼠(Peromyscus leucopus)的转录组资源,包含通过454和SOLiD 5500XL平台测序组装的参考转录组、注释信息、SNP、SSR标记及基因表达差异分析结果,用于研究城市与农村种群的生态遗传分化及对城市化的进化响应,共9个文件。 文件详解 转录组序列文件...
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  • Zosterops_borbonicus_based留尼汪岛绣眼鸟羽毛颜色多态性进化数据

    2026年1月13日   

    数据集概述 本数据集为留尼汪岛绣眼鸟羽毛颜色多态性研究的支撑数据,包含该鸣禽高地种群中棕色与灰色羽毛表型的表型记录、基因组变异及微卫星等分子数据,用于揭示染色体1上新基因座对黑色素表型多态性的调控机制及平衡选择下的进化过程。 文件详解 文件名称:Localities_Morphs_individuals_VCF.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • Genome_wide_Rainbow_Darter_基因组多样性与热应激耐受性研究数据

    2026年1月13日   

    数据集概述 本数据集围绕彩虹镖鲈(Etheostoma caeruleum)的基因组多样性与栖息地适应性展开,包含8个采样点(含独特湖泊栖息地)的形态特征、热耐受性及基因组数据,用于分析种群结构、遗传多样性与环境胁迫响应的关系,共9个文件。 文件详解 基因组与种群结构相关文件 文件名称:VCF_RDarters.vcf 文件格式:VCF...
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  • Corallorhiza_Lineage_Role_异养兰花复合群谱系与整合分类研究数据

    2026年1月13日   

    数据集概述 本数据集为异养兰花Corallorhiza striata复合群的谱系与整合分类研究数据,包含基因组、形态、物候、繁殖模式、生态位及真菌宿主等多源数据,采用“谱系+生态角色”方法分析物种界定,涉及13个文件,覆盖序列比对、SNP数据、形态统计、开花时间等内容。 文件详解 基因组相关文件...
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  • Icelandic_isopods_Based_冰岛深海等足类物种形成与杂交整合研究数据

    2026年1月13日   

    数据集概述 本数据集围绕冰岛深海等足类Haploniscus bicuspis的物种形成与杂交展开,整合线粒体COI序列、核基因座(ddRAD)、蛋白质组学图谱及形态特征数据,识别出5个遗传谱系,揭示了格陵兰-冰岛-法罗脊南北侧的物种分化、杂交及基因流情况,为深海生物进化研究提供多组学支撑,共包含34个文件。 文件详解 元数据与说明文件...
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  • Concordant_patterns_Coregonus物种形态同位素遗传变异研究数据

    2026年1月13日   

    数据集概述 本数据集为研究苏必利尔湖西部Coregonus artedi复合体生态辐射的多维度数据,包含形态测量、稳定同位素及转录组SNP数据,共5个文件。数据用于分析物种间形态、生态与基因组变异的一致性,探究低遗传分化下的生态差异及物种形成机制,为理解生物多样性起源提供支持。 文件详解 README.docx 文件格式:DOCX...
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  • Necturus_maculosus_Based_水生蝾螈种群结构与基因流基因组评估数据

    2026年1月13日   

    数据集概述 本数据集为水生蝾螈(Necturus maculosus)种群结构与基因流的基因组评估数据,包含美国肯塔基州三个流域(肯塔基河、利金河、金尼科尼克河)的基因组分析相关文件,用于探究河流网络结构、地理屏障等因素对种群遗传分化的影响。 文件详解 文件名称:bpp.zip 文件格式:ZIP...
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  • Galaxy_Training_Network_JBrowse基因组数据可视化教程数据集

    2026年1月13日   

    数据集概述 本数据集是Galaxy Training Network中JBrowse基因组数据可视化教程的配套数据,包含10个不同类型的基因组相关文件,覆盖DNA测序、RNA-Seq、基因注释、变异数据等内容,用于支持JBrowse工具的可视化操作训练与实践。 文件详解 基因组序列文件 文件名称:genome.fa 文件格式:FA...
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  • Capsella_bursa_pastoris_Based_欧亚多倍体植物基因组殖民化研究数据

    2026年1月12日   

    数据集概述 本数据集聚焦荠菜(Capsella bursa-pastoris)这一异源多倍体植物,通过基因分型测序获取261份欧亚大陆样本的4274个SNP位点,分析其基因组多样性、种群结构及殖民化历史,揭示其从中东向欧洲、东亚扩张的多阶段过程,为多倍体植物进化研究提供数据支持。 文件详解 README文件...
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  • Woods_2016_Brachypodium_distachyon开花时间变异遗传结构补充数据

    2026年1月11日   

    数据集概述 本数据集是论文《Brachypodium distachyon开花时间变异的遗传结构》的补充数据,包含RIL群体(F7;Bd21×Bd1-1)的基因型、表型数据、遗传图谱、基因位置文件、QTL分析R脚本及目标基因的VCF文件,支持开花时间遗传机制研究。 文件详解...
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  • Bioclimatic_Model_Based_马达加斯加热带森林碳储量气候变化预测数据_研究数据集

    2026年1月3日   

    数据集概述 本数据集基于生物气候包络模型,结合马达加斯加1771个森林样地(1996-2013年)数据,分析气候变量对热带森林地上碳密度的影响,预测2080年RCP8.5情景下碳储量变化。包含模型、栅格数据、投影文件等10个文件,支持森林碳储量与气候变化关系研究。 文件详解 文档文件 文件名称:README_for_ACD.txt 文件格式:TXT...
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  • Genome_wide_SNP_Based_Castanea_alabamensis非杂交起源研究数据

    2026年1月3日   

    数据集概述 本数据集为支持Castanea alabamensis非杂交起源的全基因组序列分型研究数据,包含北美栗属(Castanea)多个类群(含美洲栗、矮栗及亚洲栗属物种)的基因组数据,通过十万余个单核苷酸多态性(SNP)位点分析,验证了Castanea alabamensis的非杂交起源,共包含4个文件。 文件详解 文档文件...
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