找到57个数据集

分类: 公开数据 标签: Newick格式

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  • 核基因系统发育研究_蕨类植物进化历史数据

    2026年2月9日 30 18 5

    数据集概述 本数据集为基于25个低拷贝核基因的蕨类植物进化历史研究数据,包含73种蕨类及12种外类群物种的分子系统发育分析相关文件,支持蕨类系统发育关系与演化时间尺度的研究,用于补充叶绿体数据依赖的局限,共含7个文件。 文件详解 代码文件(.py格式,共4个)...
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  • 压抑对进化获益的影响及基因表达模式研究数据集

    2026年2月9日 30 57 21

    数据集概述 本数据集为论文“Repression precedes independent evolutionary gains of a highly specific gene expression pattern”的配套数据,包含系统发育树文件、基因位点文档、序列比对及分区文件等,共5个文件,用于支持基因表达模式进化机制的研究。 文件详解...
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  • JVS_树木功能性状环境选择研究数据2021

    2026年2月1日 30 146 123

    数据集概述 本数据集是论文“Historical and current environmental selection on functional traits of trees in the Atlantic Forest biodiversity...
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  • Cope_Based_新生代哺乳动物体型演化与生态特化研究数据

    2026年2月8日 30 45 24

    数据集概述 本数据集围绕Cope法则(地质时间内谱系体型增大趋势)展开,通过系统发育分析揭示新生代哺乳动物体型演化规律,指出生态特化和分支生态位扩张是体型增大的主因,同时记录全球冷却期大型物种起源脉冲与伯格曼法则的关联。 文件详解 README_for_Tree...
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  • 莱氏蝠科动物的进化史_表型特征及回声定位相关性状数据

    2026年1月31日 30 148 141

    数据集概述 本数据集是论文《Phenotypic traits evolution and morphological traits associated with echolocation calls in cryptic horseshoe bats...
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  • Petunia_Based红色花色素复杂演化机制研究数据

    2026年1月30日 30 156 55

    数据集概述 本数据集记录了矮牵牛(Petunia)红色花色素复杂演化机制的研究数据,包含蛋白质序列比对、系统发育树、基因注释、表型与基因型关联数据等40个文件,涉及花色素生物合成通路基因、MYB转录因子等关键分子的分析资料,用于揭示红色花色素从无色祖先演化的遗传机制。 文件详解 序列比对文件...
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  • Dataset_manuscript_生物基因数据集手稿数据

    2026年1月29日 30 139 79

    数据集概述 本数据集包含生物基因相关的手稿数据,涵盖基因序列比对、系统发育树及原始数据等内容。共8个文件,涉及FASTA、TRE、XLSX、GENEIOUS四种格式,主要用于生物信息学领域的基因数据处理与分析。 文件详解...
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  • 环境微生物学补充材料1_黑海厌氧系统微生物脂质生产者研究数据

    2026年1月29日 30 59 9

    数据集概述 本数据集为论文《Discovering hidden archaeal and bacterial lipid producers in a euxinic marine system》的补充材料,包含表格、图表、系统发育树等7个文件,覆盖黑海 euxinic 海洋系统中微生物脂质生产者的相关数据,支持对该环境中潜在微生物类群的研究。...
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  • Am_Nat_Based_硬骨鱼类代谢率生态形态关联研究数据

    2026年1月29日 30 189 177

    数据集概述 本数据集包含131种硬骨鱼类的静息代谢率(RMR)和最大代谢率(MMR)数据,结合生态、形态变量及系统发育关系,用于分析代谢率变异的近因与终极因素。数据支持进化生物学研究,探究代谢能力与生态生活方式、形态特征的关联。 文件详解 Killen et al Am Nat Table S1.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • 代谢组学引导的基因组比较研究_哺乳动物冬眠基因趋同进化数据分析

    2026年1月28日 30 5 4

    数据集概述 本数据集配套“Genes Underlying Adaptive Physiological Shifts Among Hibernating Mammals”手稿,包含基因组、系统发育及功能富集数据,用于研究哺乳动物冬眠相关性状(尤其是肉碱代谢)的进化机制,覆盖物种树、基因树、功能富集等多类型资源。 文件详解 系统发育资源...
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  • Vertebrate_脊椎动物基因家族系统发育树数据集_2002

    2026年1月28日 30 2 0

    数据集概述 本数据集包含118个脊椎动物基因家族的系统发育树,用于James Cotton和Roderic Page在2002年发表的两篇论文。数据涵盖基因序列文件、系统发育树文件、分类重叠图及基因家族列表,支持基因进化关系与分类学分析。 文件详解 压缩包文件 文件名称:genes.zip 文件格式:ZIP...
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  • Lemur_Niche_Based_狐猴环境生态位趋同演化研究数据

    2026年1月27日 30 58 52

    数据集概述 本数据集围绕狐猴环境生态位的趋同演化展开,包含83种现存狐猴的气候、海拔及系统发育等数据,通过多峰Ornstein-Uhlenbeck模型等方法验证其生态位趋同假设,涉及马达加斯加西南干旱栖息地的适应性演化分析,共含4个相关文件。 文件详解 文件名称:Supp_Inf.docx 文件格式:DOCX...
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  • Apogonidae_Based_天竺鲷科鱼类视觉系统适应性研究数据

    2026年1月25日 30 92 35

    数据集概述 本数据集围绕天竺鲷科鱼类的视觉系统适应性展开,包含28种大堡礁天竺鲷的视网膜转录组测序数据、视蛋白基因表达分析及光谱敏感性预测结果,结合7个物种的显微分光光度法测量数据,探究其昼夜活动模式下的视觉基因多样性与进化适应特征。 文件详解 基因序列文件(.fasta格式,共6个)...
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  • 数据18S_rRNA_Based_水生真菌栖息地特异性群落参考数据集

    2026年1月23日 30 177 51

    数据集概述 本数据集整合了公开的真菌18S rRNA基因序列与海洋真菌培养物新序列,补充了10类栖息地类型等验证上下文数据,包含系统发育参考树,用于分析水生真菌群落模式、栖息地对群落结构的影响及分类组成差异,为水生真菌研究提供参考。 文件详解 README_for_aquatic_fungal_communities.txt 文件格式:TXT...
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  • Convergence_鱼类BCF波动游泳运动学与形态学比较研究数据集

    2026年1月22日 30 52 40

    数据集概述 本数据集为44种不同鱼类的身体与尾鳍(BCF)波动游泳运动学与形态学比较研究数据,包含运动学参数、形态特征及相关分析文件,揭示传统游泳模式分类与实际运动学特征的差异,支持水生运动机制及仿生机器人研究。 文件详解 数据文件...
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  • Vibrio_T3SS2_Based细菌分泌系统效应蛋白分布研究补充数据集

    2026年1月21日 30 20 12

    数据集概述 本数据集是关于弧菌III型分泌系统2(T3SS2)的研究补充数据,包含T3SS2系统的系统发育树、基因组登录号表、效应蛋白预测表及聚类分析文件,涉及效应蛋白的分布特征与系统进化信息,共6个文件。 文件详解 系统发育树相关文件 文件名称:T3SS2 phylogenetic tree Newick.txt 文件格式:TXT...
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  • Amatitlania_Based_中美洲慈鲷系统地理学与物种界定研究数据

    2026年1月21日 30 156 99

    数据集概述 本数据集聚焦中美洲慈鲷科Amatitlania属的系统地理学模式与物种界定研究,包含318个个体的线粒体DNA序列分析结果,涉及该属全部3个已识别物种的地理分布范围。数据支持将Amatitlania属划分为2个独立物种,并揭示其更新世以来的演化历史,共包含23个相关文件。 文件详解 系统发育分析文件...
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  • Emberizoidea_Based_新大陆鸟类系统发育与生物地理学研究数据

    2026年1月20日 30 79 16

    数据集概述 本数据集包含新大陆鸟类类群Emberizoidea(涵盖麻雀、主红雀、黑鸟、林莺、唐纳雀等约832种)的近物种水平系统发育树及相关分析文件,是目前该类群最完整(≥95%)的系统发育假说资源,支持生物地理起源、演化动态及生态过程研究。 文件详解 文档类文件(.txt格式,共4个)...
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  • Mammalian_Intestinal_Based哺乳动物肠道异速生长与生态特征研究数据集

    2026年1月17日 30 42 33

    数据集概述 本数据集收集了519种哺乳动物的肠道各段长度、体重数据,以及营养级、气候和其他生物学特征信息,用于验证肠道尺寸与食性、系统发育、气候等因素的关系。数据包含肠道形态测量值、系统发育关系及相关文献参考,可支持哺乳动物消化系统生态学的多维度分析,共包含3个文件。 文件详解 文件名称:MammalIntestine_Data.xlsx...
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  • Limulus_polyphemus_Based_美洲鲎视蛋白基因组注释与进化分析数据

    2026年1月14日 30 6 0

    数据集概述 本数据集为美洲鲎(Limulus polyphemus)视蛋白基因组研究的相关数据,包含视蛋白基因库的系统发育分析文件、进化树结构文件及 phyloseq 数据库文件,用于支撑美洲鲎视蛋白家族的注释、系统发育关系分析及组织表达模式研究,为理解螯肢动物视蛋白进化及节肢动物视觉系统演化提供数据资源。 文件详解...
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