找到99个数据集

标签: VCF

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  • Oreochromis_niloticus_Based刚果民主共和国引入种群基因组研究数据集

    2026年1月17日 30 34 32

    数据集概述 本数据集用于研究刚果民主共和国引入的尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)种群基因组特征,包含213份尼罗罗非鱼样本(来自原生及引入区域)和48份其他罗非鱼物种样本的基因分型数据,通过RAD测序获得27611个SNP位点,可分析种群分化、遗传混杂及入侵后果。 文件详解 文件名称:README.docx 文件格式:DOCX...
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  • Walleye_Harvest_Associated_野生白斑狗鱼种群体型与基因组变化研究数据

    2026年1月11日 30 104 10

    数据集概述 本数据集记录了魁北克Mistassini湖三个捕捞种群及一个低捕捞参考种群15年间的体型、年龄及基因组变化,包含约9000个SNP位点的分析数据,结合原住民知识,揭示捕捞诱导的表型与遗传耦合变化,为渔业资源管理提供依据。 文件详解 VCF文件(2个) 文件名称:Bowles_et_al-...
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  • Pocillopora_Based_Indo_Pacific珊瑚多标准物种界定研究数据_2023

    2026年1月9日 30 165 111

    数据集概述 本数据集为Indo-Pacific海域Pocillopora珊瑚的物种界定研究数据,基于基因组学、形态学、生物地理学及共生生态学多标准展开。包含356个珊瑚群体的全基因组SNP数据、微形态测量数据、共生藻关联数据等,用于解析该属珊瑚系统发育、提出物种假说并验证多证据一致性,支持珊瑚分类修订与保护。 文件详解 基因组与遗传数据...
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  • stickleback_genome_Based_三刺鱼种群全基因组序列分析数据

    2026年1月15日 30 116 49

    数据集概述 本数据集包含81个三刺鱼全基因组序列分析结果,覆盖太平洋北美、格陵兰及北欧16个种群。通过核SNPs主成分分析、线粒体基因组序列分析及全基因组重组 coalescence 方法,揭示不同地理区域种群的分化特征、谱系混合模式及种群动态历史差异,为三刺鱼适应性进化研究提供基础数据。 文件详解 文件名称:mtDNA_alignments.zip...
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  • Patella_Based_Canary_Islands濒危帽贝遗传分化研究数据

    2026年1月15日 30 147 17

    数据集概述 本数据集为Canary Islands濒危帽贝Patella candei candei的遗传分化研究数据,包含SNP数据集及COX1序列分析输入文件,支持种群遗传结构、物种分类关系及保护单元划分的研究,共5份文件。 文件详解 README.txt 文件格式:TXT...
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  • Beacon_Training_Material_Beacon_V2教程训练数据

    2026年1月15日 30 170 89

    数据集概述 本数据集为Galaxy Training Material中“Working with Beacon V2”教程的训练数据,包含来自1000 Genomes Project和GDC数据库的5个文件,覆盖JSON、XLSX、VCF、TSV格式,用于指导用户学习Beacon V2的构建、数据转换、导入及变体查询技能,支撑教程中的实操练习。...
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  • RAD_Based_Alvord_Basin丘头鱼种群遗传结构与演化历史研究数据

    2026年1月15日 30 196 172

    数据集概述 本数据集为美国俄勒冈州东南部及内华达州北部Alvord Basin区域的Alvord丘头鱼与Borax Lake丘头鱼遗传结构研究数据,通过RAD测序技术获取遗传变异信息,分析种群遗传结构、物种间亲缘关系及演化历史,包含8个相关文件。 文件详解 数据文件 文件名称:Data1_batch_1.catalog.tags.tsv...
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  • Oregon_junco_Based_歌雀谱系分化基因组漂移与局部适应性研究数据

    2026年1月15日 30 4 1

    数据集概述 本数据集聚焦北美西部俄勒冈歌雀的快速谱系分化过程,包含基因组水平的SNP位点数据及环境变量数据,用于研究中性漂移与局部适应性在种群分化中的相对作用,涉及孤立干旱山区种群与湿润北部种群的遗传结构差异,支持遗传-环境关联分析。 文件详解 基因组变异数据文件(.vcf格式,共4个)...
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  • WBPH_2b_RAD_Based_大湄公河次区域迁入中国北方白背飞虱基因测序数据

    2026年1月15日 30 72 3

    数据集概述 本数据集通过2b-RAD测序技术,分析了大湄公河次区域(GMS)白背飞虱(WBPH)迁入中国北方的种群遗传结构。包含18个山东站点及6个GMS区域的样本基因数据,揭示了迁入来源、遗传多样性及种群聚类特征,为明确白背飞虱迁移路线及来源提供支撑。 文件详解 基因测序结果文件...
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  • CNVkit_Based_RD_Connect_GPAP合成数据拷贝数变异检测数据

    2026年1月15日 30 195 56

    数据集概述 本数据集是从Zenodo原始BAM文件集合中提取的子集,基于RD-Connect GPAP合成数据进行处理,通过CNVkit检测拷贝数变异,仅保留感兴趣区域。数据集包含72个文件,涵盖.cns、.vcf、.json三种格式,聚焦于基因组拷贝数变异的分析研究。 文件详解 文件类型与分布...
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  • Alvarado_Serrano_Based_紫茉莉入侵杂草连通性影响因素研究数据

    2026年1月15日 30 192 28

    数据集概述 本数据集聚焦入侵杂草紫茉莉(Ipomoea purpurea)的种群遗传结构与连通性,包含其SNP、SSR分子标记数据及景观变量数据,用于分析自然景观与人为因素对该物种基因流的影响,助力理解入侵物种扩散机制与管理策略制定。 文件详解 文档类文件(.txt格式) README_for_Alvarado-Serrano et...
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  • Quercus_rugosa_Landscape_墨西哥高山栎气候相关遗传变异数据

    2026年1月15日 30 20 16

    数据集概述 本数据集围绕墨西哥高山栎(Quercus rugosa)种群的气候适应性遗传变异展开,通过基因分型测序获取17个采样点103个个体的5354个单核苷酸多态性(SNPs)数据,结合梯度森林模型分析遗传变异与气候因子的关联,识别气候适应相关基因位点,为该物种的气候适应研究及保护管理提供数据支持。 文件详解...
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  • Passer_domesticus_Based_肯尼亚麻雀范围扩张表观遗传研究数据

    2026年1月14日 30 10 6

    数据集概述 本数据集围绕肯尼亚家麻雀约七十年范围扩张过程中的表观遗传潜力展开研究,包含五个区域的CpG位点数量及DNA甲基化数据。核心探索CpG位点数量在扩张前沿与核心区域的分布差异,分析其是否受选择驱动,以及DNA甲基化在扩张中的变化规律,为表观遗传机制推动物种扩张提供数据支撑。 文件详解...
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  • 波罗等人基于绿海葵_Anemonia_viridis_共生菌获取遗传数据_补充资料

    2026年1月14日 30 130 72

    数据集概述 本数据集为Porro et al.关于地中海蛇锁海葵(Anemonia viridis)共生菌水平获取机制研究的补充数据,包含宿主动物单核苷酸多态性(SNPs)数据、共生菌ITS2序列数据及共生菌组成表格,用于分析宿主与共生菌群落的关联模式及水平获取能力。 文件详解 README.txt 文件格式:TXT...
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  • Rana_pipiens_Based_草原坑洼区豹蛙遗传连通性与景观因子关联研究数据

    2026年1月14日 30 68 51

    数据集概述 本数据集围绕草原坑洼区北部豹蛙(Rana pipiens)的遗传连通性展开,通过景观遗传学分析探究土地利用与地形对其种群遗传分化的影响。包含22个采样点的SNP基因分型数据、10类景观变量的栅格数据及连通性建模结果,共33个文件,为两栖动物保护及栖息地管理提供科学依据。 文件详解 栅格数据文件...
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  • Raeymaekers_NatCommun_2017_三刺与九刺棘鱼适应性分化研究数据

    2026年1月14日 30 6 1

    数据集概述 本数据集包含三刺和九刺棘鱼的基因分型及相关研究数据,用于分析两种亲缘关系相近的鱼类在共同生境中沿盐度梯度的中性与适应性分化差异。数据支撑对物种特异性适应能力、表型平行性与基因组非平行适应性的研究,共含3个文件。 文件详解 九刺棘鱼基因分型文件 文件名称:Raeymaekers et al-...
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  • Peromyscus_leucopus_Based_白足鼠城市与农村种群转录组资源数据

    2026年1月13日 30 93 1

    数据集概述 本数据集为白足鼠(Peromyscus leucopus)的转录组资源,包含通过454和SOLiD 5500XL平台测序组装的参考转录组、注释信息、SNP、SSR标记及基因表达差异分析结果,用于研究城市与农村种群的生态遗传分化及对城市化的进化响应,共9个文件。 文件详解 转录组序列文件...
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  • Zosterops_borbonicus_based留尼汪岛绣眼鸟羽毛颜色多态性进化数据

    2026年1月13日 30 57 18

    数据集概述 本数据集为留尼汪岛绣眼鸟羽毛颜色多态性研究的支撑数据,包含该鸣禽高地种群中棕色与灰色羽毛表型的表型记录、基因组变异及微卫星等分子数据,用于揭示染色体1上新基因座对黑色素表型多态性的调控机制及平衡选择下的进化过程。 文件详解 文件名称:Localities_Morphs_individuals_VCF.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • Genome_wide_Rainbow_Darter_基因组多样性与热应激耐受性研究数据

    2026年1月13日 30 51 47

    数据集概述 本数据集围绕彩虹镖鲈(Etheostoma caeruleum)的基因组多样性与栖息地适应性展开,包含8个采样点(含独特湖泊栖息地)的形态特征、热耐受性及基因组数据,用于分析种群结构、遗传多样性与环境胁迫响应的关系,共9个文件。 文件详解 基因组与种群结构相关文件 文件名称:VCF_RDarters.vcf 文件格式:VCF...
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  • Corallorhiza_Lineage_Role_异养兰花复合群谱系与整合分类研究数据

    2026年1月13日 30 144 9

    数据集概述 本数据集为异养兰花Corallorhiza striata复合群的谱系与整合分类研究数据,包含基因组、形态、物候、繁殖模式、生态位及真菌宿主等多源数据,采用“谱系+生态角色”方法分析物种界定,涉及13个文件,覆盖序列比对、SNP数据、形态统计、开花时间等内容。 文件详解 基因组相关文件...
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