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Hucho_taimen_Based_哲罗鲑转录组从头组装与特征分析数据
数据集概述 本数据集为哲罗鲑(Hucho taimen)的转录组从头组装与特征分析结果,包含转录组序列、功能注释、基因家族分析、正选择基因鉴定及微卫星标记等数据,共11个压缩文件,可用于研究该濒危物种的保护遗传学、系统发育及进化机制。 文件详解 文件名称:Index_and_primers_for_genotype.zip 文件格式:ZIP...
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弗林索玛_Phrynosoma_物种的参考分类学_生物多样性及系统发育评估
数据集概述 本数据集为角蜥属(Phrynosoma)物种的系统基因组生物多样性评估数据,包含ddRADseq和线粒体DNA等分子数据文件,用于构建参考分类框架,解决大短角蜥物种复合体的物种界定争议,支持物种树构建、分歧时间估算及种群遗传分析,共9个相关文件。 文件详解 文件名称:README.txt 文件格式:TXT...
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King_Penguins_Based_亚南极王企鹅种群遗传分化与扩散研究数据
数据集概述 本数据集为亚南极王企鹅种群遗传分化与扩散研究的核心数据,包含通过RADSeq技术生成的5154个高覆盖度单核苷酸多态性(SNP)位点数据,覆盖福克兰群岛、南乔治亚、克罗泽群岛及麦夸里岛的王企鹅种群。数据用于分析种群遗传结构、扩散模式及殖民化历史,揭示跨数千公里海域的王企鹅种群遗传分化极轻微的特征,为物种保护规划提供依据。 文件详解...
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Selasphorus_sasin_Based_艾伦蜂鸟南加州种群基因研究数据
数据集概述 本数据集围绕加州艾伦蜂鸟(Selasphorus sasin)的三个种群(迁徙型、南加州大陆定居型、海峡群岛定居型)开展基因研究,通过单核苷酸多态性(SNP)分析探究其遗传关系,核心发现南加州大陆种群为两个亚种的杂交后代。数据集包含基因数据、样本信息、分析代码等11个文件,支持种群基因组学分析。 文件详解 数据文件...
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Heliconius_Based蝴蝶适应性颜色模式分化与趋同基因组结构研究数据
数据集概述 本数据集围绕Heliconius蝴蝶适应性颜色模式分化与趋同的基因组结构展开,通过全基因组重测序等技术,分析了其杂交区的遗传变异,识别了调控红色颜色模式变异的基因组区间,探究了适应性等位基因的进化历史,为理解生物多样性起源提供支撑。 文件详解 序列与进化分析文件(.nex格式,共19个)...
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HawaiianTaro_SNP_Based夏威夷芋头基因组系统发育与育种数据
数据集概述 本数据集包含通过全基因组SNP分型获得的夏威夷芋头(Colocasia esculenta)相关数据,涵盖70份来自夏威夷、南太平洋、帕劳及亚洲大陆的芋头样本,涉及系统发育关系、育种意义及栽培历史研究,包含2个压缩文件。 文件详解 文件名称:HawaiianTaro_SNP.vcf.zip 文件格式:ZIP(压缩包)...
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Arabidopsis_lyrata_Based冰期后自交与异交生态型形成研究数据
数据集概述 本数据集围绕Arabidopsis lyrata亚种冰期后生态型形成展开,包含20个种群的全基因组重测序关联分析结果、根系形态数据、群体ID及连锁不平衡估计等信息,聚焦底物适应相关基因及交配系统转变对生态型形成的影响,共5个文件。 文件详解 Outlier_SNPs.zip 文件格式:ZIP...
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Phaseolus_vulgaris_Based_野生菜豆环境适应基因组学研究数据
数据集概述 本数据集基于景观基因组学方法,对覆盖墨西哥至阿根廷10000公里分布范围的246份野生菜豆(Phaseolus vulgaris)材料进行约20K SNP基因分型,通过离群位点检测和生物气候变量关联分析,识别环境适应相关候选基因,为菜豆遗传改良提供分子标记资源。 文件详解 文件名称:Haplotype blocks.xlsx...
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Helicoverpa_armigera_Based全球种群结构与基因流动研究数据
数据集概述 本数据集为全球农业害虫棉铃虫(Helicoverpa armigera)的种群结构与基因流动研究数据,涵盖六大洲种群的线粒体基因组、基因分型及全基因组序列等信息,用于分析其种群来源、基因交流及与近缘种的关系,助力生物安全风险评估。 文件详解 文件名称:b3_b1b2_snps.vcf.bz2 文件格式:VCF.BZ2...
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Mallotus_villosus_Based_海洋鱼类局部适应遗传与环境关联数据集
数据集概述 本数据集围绕海洋鱼类毛鳞鱼(Mallotus villosus)的局部适应机制展开,包含基因组SNP数据、产卵场环境数据及种群信息。通过分析基因流、祖先多态性和染色体重排对局部适应的影响,为理解高基因流下海洋生物的适应性进化提供支撑,共含3个核心文件。 文件详解...
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Dryad_Based_西南印度洋_Pocillopora_珊瑚种群基因组与连通性研究数据
数据集概述 本数据集包含西南印度洋4种Pocillopora珊瑚的种群基因组数据,通过目标捕获技术获取单核苷酸多态性(SNPs),覆盖9个采样点的千余个珊瑚群体。数据用于分析种群遗传结构、连通性及 demographic 历史,为珊瑚礁保护提供遗传学依据,共含16个文件。 文件详解 核心数据文件...
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Japanese_macaque_Phylogeographic_history_data
数据集概述 本数据集为日本猕猴系统地理学研究数据,包含11个文件,涵盖遗传分析代码、序列数据、种群结构分析结果等。主要用于探究日本猕猴的地理遗传变异模式及进化过程,支持种群结构、基因流、末次盛冰期避难所分布等研究,为理解其系统发育历史提供数据支撑。 文件详解 代码文件 文件名称:calc_pi.R 文件格式:R...
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stickleback_genome_Based_三刺鱼种群全基因组序列分析数据
数据集概述 本数据集包含81个三刺鱼全基因组序列分析结果,覆盖太平洋北美、格陵兰及北欧16个种群。通过核SNPs主成分分析、线粒体基因组序列分析及全基因组重组 coalescence 方法,揭示不同地理区域种群的分化特征、谱系混合模式及种群动态历史差异,为三刺鱼适应性进化研究提供基础数据。 文件详解 文件名称:mtDNA_alignments.zip...
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Patella_Based_Canary_Islands濒危帽贝遗传分化研究数据
数据集概述 本数据集为Canary Islands濒危帽贝Patella candei candei的遗传分化研究数据,包含SNP数据集及COX1序列分析输入文件,支持种群遗传结构、物种分类关系及保护单元划分的研究,共5份文件。 文件详解 README.txt 文件格式:TXT...
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RAD_Based_Alvord_Basin丘头鱼种群遗传结构与演化历史研究数据
数据集概述 本数据集为美国俄勒冈州东南部及内华达州北部Alvord Basin区域的Alvord丘头鱼与Borax Lake丘头鱼遗传结构研究数据,通过RAD测序技术获取遗传变异信息,分析种群遗传结构、物种间亲缘关系及演化历史,包含8个相关文件。 文件详解 数据文件 文件名称:Data1_batch_1.catalog.tags.tsv...
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Alvarado_Serrano_Based_紫茉莉入侵杂草连通性影响因素研究数据
数据集概述 本数据集聚焦入侵杂草紫茉莉(Ipomoea purpurea)的种群遗传结构与连通性,包含其SNP、SSR分子标记数据及景观变量数据,用于分析自然景观与人为因素对该物种基因流的影响,助力理解入侵物种扩散机制与管理策略制定。 文件详解 文档类文件(.txt格式) README_for_Alvarado-Serrano et...
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Passer_domesticus_Based_肯尼亚麻雀范围扩张表观遗传研究数据
数据集概述 本数据集围绕肯尼亚家麻雀约七十年范围扩张过程中的表观遗传潜力展开研究,包含五个区域的CpG位点数量及DNA甲基化数据。核心探索CpG位点数量在扩张前沿与核心区域的分布差异,分析其是否受选择驱动,以及DNA甲基化在扩张中的变化规律,为表观遗传机制推动物种扩张提供数据支撑。 文件详解...
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PeerJ_16427_Urophora_cardui种群微卫星与SNP标记特征数据
数据集概述 本数据集包含来自PeerJ论文的Urophora cardui种群遗传标记数据,涵盖微卫星位点和SNP标记的特征信息,用于分析该物种近缘种群的遗传多样性与分化情况,支持种群遗传学研究与生物防治应用。 文件详解 微卫星基因型数据文件 文件名称:Uc_microsats_Genepop.txt 文件格式:TXT...
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Peromyscus_leucopus_Based_白足鼠城市与农村种群转录组资源数据
数据集概述 本数据集为白足鼠(Peromyscus leucopus)的转录组资源,包含通过454和SOLiD 5500XL平台测序组装的参考转录组、注释信息、SNP、SSR标记及基因表达差异分析结果,用于研究城市与农村种群的生态遗传分化及对城市化的进化响应,共9个文件。 文件详解 转录组序列文件...
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Genome_wide_Rainbow_Darter_基因组多样性与热应激耐受性研究数据
数据集概述 本数据集围绕彩虹镖鲈(Etheostoma caeruleum)的基因组多样性与栖息地适应性展开,包含8个采样点(含独特湖泊栖息地)的形态特征、热耐受性及基因组数据,用于分析种群结构、遗传多样性与环境胁迫响应的关系,共9个文件。 文件详解 基因组与种群结构相关文件 文件名称:VCF_RDarters.vcf 文件格式:VCF...



