数据集 - 海数据

数据集概述本数据集围绕榕树（Ficus）与传粉榕小蜂（Agaonidae）的专性传粉共生关系展开，通过分子标记分析中国南部及台湾-琉球群岛6种近缘雌雄异株榕树及其传粉者的系统发育关系与种群遗传结构，探究宿主转移导致的传粉者物种形成机制，揭示传粉者共享、协同传粉等现象，为专性传粉共生系统的物种形成与宿主特异性研究提供数据支持。文件详解文档类文件...

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Anchored_Enrichment_鲤形目系统发育基因组学分析数据集

数据集概述本数据集为鲤形目（包括鲤科、鳅科等约4300种淡水鱼类）的系统发育基因组学研究数据，基于锚定富集方法构建，包含172个鲤形目类群及3个外群的219个基因座（总长315,288 bp），旨在解决该类群系统发育关系的争议，为进化生物学研究提供框架。文件详解文件名称：LociPartitions.txt 文件格式：TXT...

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Phylogenies_Based_系统发育分化时间与多样化速率评估数据

数据集概述本数据集围绕系统发育分化时间与多样化速率估计展开，通过模拟实验和实证分析评估相关方法的有效性。核心内容包括对替代率、物种形成率、灭绝率等变量的分析，以及特征采样和分类群采样对参数估计的影响，为宏观进化历史研究提供方法学参考。文件详解代码文件格式：.rev、.r、.py...

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Y_chromosome_Based_棕熊与北极熊Y染色体基因流研究数据

数据集概述本数据集为棕熊与北极熊Y染色体基因流研究相关数据，基于13个新型Y染色体序列及微卫星标记，对130只棕熊和北极熊样本开展分析，还涉及390kb Y染色体支架的测序数据研究，用于揭示两者系统发育关系及雄性偏向基因流情况。文件详解文件名称：Submission DRYAD allele sizes.xlsx 文件格式：XLSX...

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Paratethys_Based欧洲淡水端足类物种复合体进化历史研究数据

数据集概述本数据集围绕欧洲淡水甲壳动物Gammarus balcanicus物种复合体展开，聚焦Paratethys海1500万年消退过程对其多样性的影响。通过线粒体与核标记及大规模采样，揭示该物种复合体的高分化水平、系统发育关系及地理分布格局，为理解欧洲淡水无脊椎动物区系起源提供依据。文件详解文件名称：Alignments.zip...

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沈等人_补充材料_盲肠科_Plethodontidae_演化时间研究数据

数据集概述本数据集为Plethodontidae蝾螈科演化时间研究的补充材料，包含基于50个独立核标记（共48,582 bp）的系统发育重建与分化时间分析相关数据，用于解决该科早期快速分化导致的系统发育关系争议，修正其起源时间假说。文件详解文件名称：Shen_et_al_Supplementary_Materials.zip 文件格式：ZIP...

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Corvoidea_Based_喜马拉雅核心鸦小目多样化生态限制研究数据

数据集概述本数据集围绕喜马拉雅核心鸦小目（Corvoidea）的物种多样性展开，通过生态、形态和系统发育信息，探究该类群物种数量低于姐妹类群的原因，核心结论为生态因素限制了其多样化。数据包含时间校准的系统发育树和形态测量表格，支持对鸟类体型、海拔分布与进化历史的关联分析。文件详解 Time calibrated tree XML.xml...

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Neobatrachia_Based_新蛙类线粒体与核基因分子进化速率数据

数据集概述本数据集包含新蛙类（Neobatrachia）及其近缘类群的线粒体全基因组与核基因序列数据，用于研究新蛙类起源过程中分子进化速率的变化。数据涵盖6种蛙类（含1种非新蛙类）的序列，支持构建系统发育树、分析线粒体与核基因替代速率差异及选择压力变化。文件详解...

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Cardioglossa_Based非洲长指蛙属系统发育与物种分化研究数据

数据集概述本数据集包含非洲长指蛙属（Cardioglossa）18个物种的系统发育分析相关文件，基于线粒体和核基因位点数据构建。涵盖系统发育树、分区方案、物种界定分析等结果，支持研究该属物种的分化时间、生物地理历史及体色分化机制，共8个文件。文件详解系统发育树文件（.tre）...

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萨门鲑鱼_Salmo_salar_在冰岛河流中的遗传结构及冰盖退缩模型数据

数据集概述本数据集包含冰岛不同河流中大西洋鲑的遗传结构研究数据，涉及26个河流样本（共2352个个体）的15个微卫星位点分析结果，揭示了冰岛北部和南部两个可区分的遗传库，以及部分位点的突变分化和历史起源证据，支持末次盛冰期后重新殖民的推论。文件详解文件名称：Salmon_Iceland_DRYAD.xlsx 文件格式：XLSX...

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Macropod_Evolution_Based_巨型灭绝袋鼠进化研究数据

数据集概述本数据集围绕巨型灭绝袋鼠的进化研究展开，整合了分子与形态学数据，包含灭绝澳大利亚巨型有袋动物的近完整线粒体基因组序列、化石数据及现存物种的可比数据，用于推断袋鼠类的系统发育、分化时间及祖先体重，探讨DNA、形态学及综合证据在进化推断中的相对效用。文件详解 Dating.rar 文件格式：RAR...

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Symbiodiniaceae_Based珊瑚共生藻系统修订与进化研究数据

数据集概述本数据集为珊瑚共生藻科（Symbiodiniaceae）系统修订研究的配套数据，包含分子序列、系统发育分析输入文件、遗传与形态学分析代码及结果日志等，支撑对该科进化历史、多样性及与珊瑚共生关系的研究，涉及中生代约1.6亿年前的分化时间校准等关键结论。文件详解分子序列文件（.nexus格式）...

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Oplurinae_Based马达加斯加鬣蜥属系统地理结构时空模式研究数据

数据集概述本数据集为马达加斯加鬣蜥亚科（Oplurinae）物种的系统地理结构研究数据，包含多基因座DNA序列数据及相关分析文件。通过放松时钟模型估算物种树和分化时间，分析Oplurus属两个姐妹种（O. cuvieri和O. cyclurus）的种群遗传结构与分化时间，探究物种多样性形成机制，共包含13个文件。文件详解 XML文件（共10个）...

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Tamiasciurus_Based北美树松鼠种群遗传多样性与基因流研究数据

数据集概述本数据集聚焦北美树松鼠（Tamiasciurus属）种群的遗传多样性与基因流研究，涵盖道格拉斯松鼠（T. douglasii）和美洲红松鼠（T. hudsonicus）的种群遗传分析数据，涉及末次冰盛期以来的分化历史、隔离与杂交事件，为理解更新世气候变化对物种分化的影响提供遗传证据。文件详解 STRUCTURE分析文件...

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USGS_USDA_Source_北美外来食草昆虫宿主广度与入侵影响分析数据

数据集概述本数据集由美国地质调查局约翰·卫斯理·鲍威尔分析与综合中心及美国农业部森林服务局支持的项目工作组编制，包含北美非本土树木取食昆虫的相关数据，涵盖昆虫特征、北美宿主植物特征及宿主物种间分化时间等信息，用于量化宿主广度并分析外来昆虫对北美树木的影响驱动因素，共含37个文件。文件详解数据文件（34个.csv格式）...

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Bauzà_Ribot_Based_地下甲壳类进化分化与板块构造关联研究数据

数据集概述本数据集围绕板块构造与进化分化的关联研究展开，针对Bauzà-Ribot等人关于大西洋岛屿地下甲壳类进化分化的研究结论，通过重新分析其线粒体数据，指出原分析存在的校准、速率建模及替代饱和问题，并推断出更年轻的分化时间节点，质疑板块构造驱动分化的结论。文件详解文件名称：README_for_amphipods30_12_rlc3.doc...

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Ithomiini_Solanaceae_Based蝴蝶分化时间校准研究数据

数据集概述本数据集为蝴蝶分化时间研究的补充材料，基于茄科植物时间树的独立校准点，重新分析新热带区Ithomiini蝴蝶的分化时间，对比不同校准方式下的年龄估计差异，探讨蝴蝶与寄主植物进化时间的一致性，为生物进化研究提供参考。文件详解文件名称：Supp_Mat_Garzonetal_systbio15.docx 文件格式：DOCX...

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gonorynchiform_Based_鼠鱚目鱼类系统发育与分化时间研究数据