找到29个数据集

分类: 公开数据 标签: PHYLIP

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  • UCE_Based_大基因组蝾螈超保守元件测序与进化分析数据

    2026年1月29日 30 13 8

    数据集概述 本数据集为针对大基因组蝾螈(Plethodon serratus)超保守元件(UCEs)的序列捕获与下一代测序数据,包含85个样本的6亿余条测序读段分析结果,用于解析种内系统地理关系与隐存种界定,验证UCEs协议在大基因组生物研究中的适用性。 文件详解 压缩文件(.zip)...
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  • Draco_Source_小巽他群岛飞蜥系统发育基因组分析数据

    2026年1月28日 0 25 20

    数据集概述 本数据集为小巽他群岛飞蜥(Draco属)的系统发育基因组分析数据,包含系统发育、物种界定、种群聚类、生物地理模型测试等相关的输入文件与结果文件,用于研究该属物种的扩散驱动分化、基因流及物种形成机制,共12个文件。 文件详解 文档类文件 文件名称:README.txt 文件格式:TXT...
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  • Amblypygi_Based鞭蛛全球系统发育与DNA序列研究数据

    2026年1月27日 30 177 13

    数据集概述 本数据集为鞭蛛(Amblypygi)全球系统发育研究相关数据,包含DNA序列比对、UCE序列比对及说明文档,支持鞭蛛分子系统发育分析、分化时间估算等研究,共5个文件,覆盖3种文件格式。 文件详解 README.docx 文件格式:DOCX 字段映射介绍:数据集说明文档,包含研究背景、数据采集与处理方法、文件内容说明等信息...
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  • Synbranchiformes_Based全球扩散生物地理学研究数据

    2026年1月26日 30 76 12

    数据集概述 本数据集包含合鳃鱼目(Synbranchiformes)鱼类的超保守元件(UCEs)测序数据及系统发育分析结果,用于研究该类群的全球扩散历史与生物地理学模式。数据支持东南亚为主要类群祖先区域的结论,排除冈瓦纳大陆分裂假说,揭示独立大陆入侵事件,共包含十五个文件。 文件详解 系统发育树文件(.tre)...
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  • Dryad_Horornis_斐济灌木莺基因流与岛屿生物地理学研究数据

    2026年1月26日 30 101 78

    数据集概述 本数据集为论文配套的数据,基于斐济灌木莺(Horornis ruficapilla)的基因组数据,研究岛屿大小和距离对基因流的影响,验证岛屿生物地理学理论在基因组层面的适用性。包含基因序列、变异数据、分析配置及结果表格等8个文件,支持相关假设检验与后续研究。 文件详解 文档文件 文件名称:README.txt 文件格式:TXT...
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  • Sarracenia_Based_北美食肉植物属系统发育关系研究数据

    2026年1月23日 30 98 89

    数据集概述 本数据集为研究北美食肉植物Sarracenia属系统发育关系的目标捕获法分析结果,包含75个样本的199个核基因序列及叶绿体基因组序列,用于解析该年轻分支(<300万年)的进化关系、生物地理起源及基因树异质性,共8个文件。 文件详解 基因树文件...
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  • MEC_Letsch_Based蜻蜓系统发育与栖息地分化研究数据2016

    2026年1月21日 30 167 56

    数据集概述 本数据集围绕蜻蜓(Anisoptera: Odonata: Insecta)的系统发育与栖息地分化展开,基于8个核基因和线粒体基因,通过模型进化框架分析栖息地使用对分化模式的影响。数据包含序列比对文件及分区方案,用于研究蜻蜓从流水(lotic)到静水(lentic)栖息地的独立殖民化过程,以及栖息地对物种形成速率的影响。 文件详解...
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  • Crotalus_mitchellii_complex_物种界定研究数据

    2026年1月21日 30 162 134

    数据集概述 本数据集围绕斑点响尾蛇(Crotalus mitchellii)复合体的物种界定展开,包含遗传(核DNA、线粒体DNA)、表型和气候相关数据,用于验证气候数据作为生理耐受性替代指标在物种界定中的有效性。通过对比不同数据类型的聚类结果,分析气候数据在物种分类中的局限性,最终为该复合体的分类修订提供依据。 文件详解...
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  • Dryad_Myrmelachista_Based蚁_植物共生趋同演化研究数据

    2026年1月19日 30 188 60

    数据集概述 本数据集为蚁-植物共生系统趋同演化研究相关数据,包含Myrmelachista属蚂蚁的超保守元件(UCE)基因组学数据、祖先状态重建文件、系统发育树文件等。研究通过分子系统发育分析揭示该属蚂蚁从机会主义到专性共生的独立演化事件,支持趋同演化假说,共包含七个文件。 文件详解 说明文档 文件名称:README.md 文件格式:MD...
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  • Euctenizidae_Based_北美陷门蛛科系统发育与生物地理学研究数据

    2026年1月19日 30 45 3

    数据集概述 本数据集围绕北美陷门蛛科Euctenizidae展开,包含新属Cryptocteniza kawtak的发现记录,通过锚定杂交富集的系统基因组学方法,重建该科的进化历史,分析属间关系、多样化速率及生物地理分布,探讨灭绝事件对类群分布的影响,为生物多样性保护提供依据。 文件详解 系统发育与进化分析文件...
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  • Struck2015_CurrentBiology_环节动物间隙领域演化研究数据

    2026年1月19日 30 18 8

    数据集概述 本数据集围绕环节动物向海洋间隙领域(沙粒间空间)的演化适应展开,通过系统基因组学方法揭示两类间隙环节动物(Dinophilidae科及Protodrilida和Polygordiidae科)分别通过幼态延续和逐步小型化两种路径适应环境,补充了间隙类群演化机制的研究视角。 文件详解...
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  • TEP_Prionurus_Species_Based_热带东太平洋刺尾鱼物种界定研究数据

    2026年1月12日 30 10 2

    数据集概述 本数据集为热带东太平洋(TEP)Prionurus属刺尾鱼的物种界定研究数据,整合了线粒体基因、核基因位点、形态测量、生态位比较等多维度信息,用于分析带斑点与无斑点表型刺尾鱼的进化关系与物种界限,结果支持二者为同一物种。 文件详解 文件名称:Nobia-maf02_SNPS.vcf,格式:VCF...
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  • Hymenoptera_UCE_Based_叶蜂与树蜂系统发育及生物地理学研究数据

    2026年1月15日 30 168 48

    数据集概述 本数据集包含叶蜂与树蜂(膜翅目)系统发育与生物地理学研究的输入文件、分析脚本及系统发育树文件,用于构建该类群的综合系统发育关系并解析其生物地理历史,共包含40个文件。 文件详解 输入文件 文件名称:BEAST_input_phylo-...
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  • Nesotrochidae_Based_新世界洞穴秧鸡新科命名线粒体基因组与系统发育数据

    2026年1月13日 30 179 92

    数据集概述 本数据集为Nesotrochidae新科命名相关研究的配套数据,包含两种鸟类(马达加斯加林秧鸡、福布斯林秧鸡)的线粒体基因组组装数据、11个线粒体基因的串联编码序列比对数据,以及基于BEAST2的系统发育分析输入输出文件,用于支持新世界洞穴秧鸡与新西兰adzebills亲缘关系的研究。 文件详解...
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  • Necturus_maculosus_Based_水生蝾螈种群结构与基因流基因组评估数据

    2026年1月13日 30 17 1

    数据集概述 本数据集为水生蝾螈(Necturus maculosus)种群结构与基因流的基因组评估数据,包含美国肯塔基州三个流域(肯塔基河、利金河、金尼科尼克河)的基因组分析相关文件,用于探究河流网络结构、地理屏障等因素对种群遗传分化的影响。 文件详解 文件名称:bpp.zip 文件格式:ZIP...
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  • Opiliones_Source_历史乙醇保存博物馆标本序列捕获系统发育基因组学研究数据

    2026年1月13日 30 149 127

    数据集概述 本数据集围绕历史乙醇保存博物馆标本的序列捕获系统发育基因组学研究展开,包含35份新鲜标本与15份历史乙醇保存标本(蛛形纲盲蛛目)的超保守元件(UCEs)测序数据,验证了该类标本在现代基因组学研究中的应用价值,涉及基因位点提取、系统发育分析等相关结果文件。 文件详解 系统发育树文件(.tre格式)...
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  • Bacidia_fuscoviridis_Based_北美温带地衣科属关系系统发育研究数据

    2026年1月12日 30 47 2

    数据集概述 本数据集为论文“Bacidia fuscoviridis, another overlooked sorediate crustose lichen widely distributed in temperate eastern North...
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  • Hidden_histories_of_gene_flow_Based墨西哥高地鸟类基因组标记数据

    2026年1月7日 30 72 10

    数据集概述 本数据集包含墨西哥高地鸟类(Aphelocoma jays)基因流研究的基因组标记数据,通过4303个超保守元件(UCEs)和2500个SNP位点,结合系统发育树、聚类算法及基因渐渗检测(如ABBA/BABA测试),揭示物种分化过程中的基因流历史。数据支持对物种形成模式的分析,共包含9个相关分析文件。 文件详解 文档文件(.txt)...
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  • 拟步甲科_Staphylinidae_中Creophilus属和Platydracus属线粒体基因组的系统发育分析数据

    2025年12月27日 30 96 89

    数据集概述 本数据集包含鞘翅目隐翅虫科Creophilus属和Platydracus属的首个线粒体基因组相关的系统发育分析数据,涵盖修剪后的矩阵、分区文件、扩展共识树及补充表格,用于支持该类群的系统发育关系研究。 文件详解 数据集压缩包(Datasets.zip)...
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  • 新西兰溪流鱼类延迟适应性辐射研究数据集

    2025年12月20日 30 81 36

    数据集概述 本数据集围绕新西兰Gobiomorphus鰕虎鱼的适应性辐射展开研究,通过系统基因组数据结合贝叶斯方法,分析其分化时间、形态特征演化与物种形成的关系,揭示适应性辐射在无竞争谱系环境下的缓慢启动现象。 文件详解 该数据集包含17个文件,覆盖分析结果、补充材料、配置文件等,具体说明如下: - 结果图表文件: -...
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