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欧洲小麦主要病原菌唑类杀菌剂抗性研究补充数据集
数据集概述 本数据集为欧洲小麦主要病原菌唑类杀菌剂抗性研究的补充资料，包含支撑研究结论的图表、表格及数据文件。核心围绕病原菌遗传多样性、抗性表型、基因关联分析等内容，为理解病原菌抗性机制提供补充数据支持。 文件详解 补充图表文件（Supplementary Figures...
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棘胸蛙全基因组重测序性别相关标记开发与验证数据集
数据集概述 本数据集基于棘胸蛙全基因组重测序数据，围绕性别相关分子标记的开发与验证展开，包含原始数据信息、质量控制结果、染色体水平SNP/InDel数量统计、样本变异可视化及基因注释等多维度数据，为两栖动物性别决定机制研究提供支撑。 文件详解 原始数据与质控文件： All_raw_data_infor.xls：XLS格式，记录原始测序数据基本信息...
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蒺藜苜蓿共生及农艺性状候选基因与遗传结构全基因组关联分析数据集
数据集概述 该数据集基于蒺藜苜蓿226个种质资源的全基因组测序数据（含超600万个SNP），开展全基因组关联分析（GWAS），探究株高、毛状体密度、开花时间、结瘤等性状的遗传基础，识别候选基因及遗传结构特征。 文件详解 数据文件（CSV格式）：...
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SNP系统发育推断的获取偏差校正数据集
数据集概述 本数据集围绕单核苷酸多态性（SNPs）在系统发育研究中的应用展开，包含计算机模拟数据及蜥蜴科（Phrynosomatidae）的双酶切RADseq（ddRADseq）实证数据，旨在评估RAD位点用于系统发育推断的准确性，并引入两种新的获取偏差校正方法。 文件详解 文件名称: SupplementMaterials.pdf 文件格式: PDF...
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SNPector_Supplementary_Based_基因序列变异多格式数据完整集合
数据集概述 该数据集为SNPector相关的补充数据，包含输入与输出数据，涉及基因序列、遗传变异等信息。文件类型多样，涵盖TSV、CSV、TXT等格式，为相关基因分析提供多维度的数据支持。 文件详解 数据文件（共6个）： Supplementary (3).tsv、Supplementary (4).tsv、Supplementary...
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蛾类属系统发育基因组学信息缺失模式与多基因座桑格数据比较数据集
数据集概述 本数据集围绕蛾类属Eupithecia的系统发育研究展开，对比了RAD测序与多基因座桑格测序的系统发育假设，分析了RAD数据的基因座缺失效应及其对系统发育信息（SNP、PIS）的影响，包含研究相关的代码、补充材料和图表文件。 文件详解 该数据集包含三类文件，具体说明如下： - 代码文件（.r格式）： -...
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vcferr_SNP基因分型错误模拟框架复现文档与代码
数据集概述 本数据集包含用于复现"vcferr: SNP基因分型错误模拟框架的开发、验证与应用"研究分析的文档与代码文件，提供了从模拟框架构建到结果验证的完整复现资源。 文件详解 文档文件： README.pdf：PDF格式，提供复现研究分析的分步说明 代码与配置文件： Snakefile：无扩展名，可能为工作流管理文件...
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油棕表达序列标签库单核苷酸多态性与插入缺失挖掘数据集
数据集概述 本数据集记录从油棕表达序列标签（EST）库中挖掘单核苷酸多态性（SNP）和插入缺失（Indel）的研究结果，包含检测到的多态性位点数量、频率及不同组织的分布差异，为油棕遗传研究提供分子标记数据支持。 文件详解 文件名称：Oil palm SNPs.pdf 文件格式：PDF...
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埃塞俄比亚特有层状齿鼠基因组多样性研究数据集
数据集概述 本数据集为埃塞俄比亚特有层状齿鼠（Otomys属）基因组多样性研究的配套表格数据，记录了ddRAD测序生成的不同占有率数据集的核心指标，包括基因座数、单核苷酸多态性、简约信息位点及样本量，为物种进化历史与分类研究提供支撑。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML 字段映射:...
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Relate量化正选择分析示例数据集
数据集概述 本数据集提供了一个完整的示例，展示如何使用Relate工具对1000 Genomes Project中CEU样本的LCT基因区域进行正选择分析。通过构建Relate树并利用RelateSelection模块，计算每个SNP的p值以量化其竞争优势。 文件详解 该数据集包含两个文件，具体说明如下： - 文件名称:...
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美国怀俄明州骡鹿景观基因组学与功能连通性数据集
数据集概述 本数据集基于美国怀俄明州406头骡鹿的4051个单核苷酸多态性（SNP）标记，分析其遗传结构与环境变量的关联，识别影响基因流动的景观因素，揭示不同遗传群体功能连通性的区域差异，为迁徙物种保护提供依据。 文件详解 说明文档类： readme.txt：TXT格式，介绍数据集的文件清单及研究背景...
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基于SNP无监督方法的精细亚群检测数据集_1000基因组项目案例研究
数据集概述 本数据集为“基于SNP无监督方法的精细亚群检测：1000基因组项目案例研究”论文的补充资料，包含实验相关的详细说明文档及经过参数过滤的1000基因组真实数据集，支持亚群检测方法的验证与复现。 文件详解 补充信息文件：...
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WorldCOM项目可交付成果1_细菌病原体中ESBL亚型流行率及选定等位基因序列数据库
数据集概述 本数据集为One Health EJP组织下WorldCOM联盟项目的可交付成果1，聚焦于沙门氏菌、大肠杆菌等细菌病原体中ESBL相关耐药基因的亚型流行率分析，包含选定等位基因的序列数据库，未纳入弯曲杆菌数据。 文件详解 文件名称:...
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手动标注的RNA相关科学文献实验数据集
数据集概述 本数据集包含从RNA相关科学文献中提取的一百个段落，所有内容均已根据LinkML模板完成实体与关系的人工标注，覆盖基因、蛋白质、RNA、化学物质、变异体（SNPs）、GO术语及疾病等关联信息，为RNA知识图谱研究提供基础数据。 文件详解 annotations.json:...
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数据1000基因组计划CEU样本Relate选择分析示例数据集
数据集概述 本数据集提供了在1000基因组计划CEU样本上运行Relate工具进行选择分析的完整示例，聚焦LCT基因附近区域，包含构建Relate树及使用RelateSelection模块计算选择p值的流程与结果，输出数据集中每个SNP的选择p值。 文件详解 文件名称: plot_manh.pdf 文件格式: PDF 内容说明:...
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黑腹果蝇雌雄繁殖适合度双变量全基因组关联研究数据集
数据集概述 该数据集包含黑腹果蝇半克隆系繁殖适合度双变量全基因组关联研究（GWAS）的代码、日志、结果及图表，使用R包“Mulitphen”分析，为昆虫繁殖适合度的遗传机制研究提供数据支持。 文件详解 日志文件（.txt格式）： log_multiphen_R_lhm.txt：记录R包加载过程（如MASS、abind等）及分析日志...
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黑腹果蝇性别特异性繁殖适合度GWAS数据集_萨塞克斯LHM样本
数据集概述 本数据集包含黑腹果蝇（萨塞克斯LHM种群样本）性别特异性繁殖适合度全基因组关联分析（GWAS）的代码、数据、日志和图表，涵盖雌性与雄性适合度的独立关联测试及基因注释结果。 文件详解 分析脚本文件： code_drive_basic_gwas.sh：Bash脚本，用于下载数据、驱动Plink进行GWAS分析及基因注释...
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果蝇对新型实验室环境适应性的选择等位基因轨迹数据集
数据集概述 该数据集记录了黑腹果蝇在新型实验室环境下的适应性进化过程，通过实验进化与Pool-Seq全基因组测序技术，识别了5000余个偏离中性预期的选择等位基因（SNP），并追踪其异质性进化轨迹（持续上升或先升后稳），为进化生物学中环境适应的基因组机制研究提供数据支持。 文件详解 文档类文件： Description of Bioinformatic...
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小红树蛙分类学研究标本与遗传样本数据表
数据集概述 本数据集为小红树蛙（Litoria rubella）分类学研究的配套表格数据，记录用于分子遗传（SNP与线粒体DNA）及形态学分析的标本与遗传样本详情，含物种信息、采集编号、地理坐标及基因库登录号等核心内容。 文件详解 文件名称：table.html 文件格式：HTML...
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果蝇表皮生长因子受体基因座核苷酸变异数据集
数据集概述 本数据集聚焦果蝇表皮生长因子受体（Egfr）基因座的核苷酸变异，涵盖三个种群250个等位基因的编码区及调控区序列分析，包含SNP、插入缺失多态性等遗传变异数据，为研究该基因座的群体遗传结构提供支持。 文件详解 该数据集包含11个文件，具体说明如下： -...
