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植物演化研究_Campanula_americana自交能力与漂变负荷演化数据
数据集概述 本数据集围绕植物Campanula americana的自交能力与漂变负荷随分布范围扩张的演化展开,包含RADseq测序数据处理文件、遗传多样性分析脚本、表型数据及相关说明文档,用于验证分布范围扩张过程中奠基者效应、有效种群大小变化对自交能力和有害突变积累的影响。 文件详解 数据处理文件 文件名称:bellmerge.vcf...
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King_Penguins_Based_亚南极王企鹅种群遗传分化与扩散研究数据
数据集概述 本数据集为亚南极王企鹅种群遗传分化与扩散研究的核心数据,包含通过RADSeq技术生成的5154个高覆盖度单核苷酸多态性(SNP)位点数据,覆盖福克兰群岛、南乔治亚、克罗泽群岛及麦夸里岛的王企鹅种群。数据用于分析种群遗传结构、扩散模式及殖民化历史,揭示跨数千公里海域的王企鹅种群遗传分化极轻微的特征,为物种保护规划提供依据。 文件详解...
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Selasphorus_sasin_Based_艾伦蜂鸟南加州种群基因研究数据
数据集概述 本数据集围绕加州艾伦蜂鸟(Selasphorus sasin)的三个种群(迁徙型、南加州大陆定居型、海峡群岛定居型)开展基因研究,通过单核苷酸多态性(SNP)分析探究其遗传关系,核心发现南加州大陆种群为两个亚种的杂交后代。数据集包含基因数据、样本信息、分析代码等11个文件,支持种群基因组学分析。 文件详解 数据文件...
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Heliconius_Based蝴蝶适应性颜色模式分化与趋同基因组结构研究数据
数据集概述 本数据集围绕Heliconius蝴蝶适应性颜色模式分化与趋同的基因组结构展开,通过全基因组重测序等技术,分析了其杂交区的遗传变异,识别了调控红色颜色模式变异的基因组区间,探究了适应性等位基因的进化历史,为理解生物多样性起源提供支撑。 文件详解 序列与进化分析文件(.nex格式,共19个)...
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Odocoileus_virginianus_白尾鹿岛群遗传分化与适应性研究数据
数据集概述 本数据集围绕安蒂科斯蒂岛(加拿大魁北克)引入的白尾鹿种群展开,包含该岛群与大陆源种群的遗传多样性、分化程度及表型差异的遗传基础数据。通过GBS技术生成8518个高质量SNP位点,分析种群遗传结构、适应性分化相关基因位点,支持种群遗传学与适应性进化研究。 文件详解 CSV数据文件(2个)...
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Arabidopsis_lyrata_Based冰期后自交与异交生态型形成研究数据
数据集概述 本数据集围绕Arabidopsis lyrata亚种冰期后生态型形成展开,包含20个种群的全基因组重测序关联分析结果、根系形态数据、群体ID及连锁不平衡估计等信息,聚焦底物适应相关基因及交配系统转变对生态型形成的影响,共5个文件。 文件详解 Outlier_SNPs.zip 文件格式:ZIP...
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Triturus_Newt_Genetic_Data_塞尔维亚东部蝾螈遗传分析数据集
数据集概述 本数据集包含对塞尔维亚东部Vrtovać地区9个Triturus蝾螈样本(含T. arntzeni模式标本及副模式标本)的核基因数据,通过二代测序获取52个标记。数据与当地4种冠螈参考序列对比,分析样本遗传成分,为物种分类提供依据。 文件详解 原始数据文件 文件名称:1 - FASTQ_IonTorrent.zip...
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VCF_Survival_Analysis_65岁以上人群椎体压缩性骨折生存分析数据
数据集概述 本数据集针对65岁以上椎体压缩性骨折(VCF)患者的生存情况展开分析,包含患者基本信息、治疗方式、合并症等因素与生存率的关联数据,旨在探究影响老年VCF患者生存的独立风险因素,为临床决策提供参考。 文件详解 文件名称:20230313_SMR-VCF_RGG_v1.xlsx 文件格式:XLSX...
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Seascape_Genetics_Based_阿拉伯半岛双带海葵鱼基因结构分析数据
数据集概述 本数据集基于ddRAD测序技术,分析阿拉伯半岛红海及亚丁湾双带海葵鱼(Amphiprion bicinctus)及阿曼特有种(Amphiprion omanensis)的基因结构,探究地理与环境因素对基因流的影响,包含基因数据、分析脚本及结果文件共9份,支持海洋生物基因结构与杂交模式研究。 文件详解 信息类文件...
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Mallotus_villosus_Based_海洋鱼类局部适应遗传与环境关联数据集
数据集概述 本数据集围绕海洋鱼类毛鳞鱼(Mallotus villosus)的局部适应机制展开,包含基因组SNP数据、产卵场环境数据及种群信息。通过分析基因流、祖先多态性和染色体重排对局部适应的影响,为理解高基因流下海洋生物的适应性进化提供支撑,共含3个核心文件。 文件详解...
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TEP_Prionurus_Species_Based_热带东太平洋刺尾鱼物种界定研究数据
数据集概述 本数据集为热带东太平洋(TEP)Prionurus属刺尾鱼的物种界定研究数据,整合了线粒体基因、核基因位点、形态测量、生态位比较等多维度信息,用于分析带斑点与无斑点表型刺尾鱼的进化关系与物种界限,结果支持二者为同一物种。 文件详解 文件名称:Nobia-maf02_SNPS.vcf,格式:VCF...
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Dryad_Based_西南印度洋_Pocillopora_珊瑚种群基因组与连通性研究数据
数据集概述 本数据集包含西南印度洋4种Pocillopora珊瑚的种群基因组数据,通过目标捕获技术获取单核苷酸多态性(SNPs),覆盖9个采样点的千余个珊瑚群体。数据用于分析种群遗传结构、连通性及 demographic 历史,为珊瑚礁保护提供遗传学依据,共含16个文件。 文件详解 核心数据文件...
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Oreochromis_niloticus_Based刚果民主共和国引入种群基因组研究数据集
数据集概述 本数据集用于研究刚果民主共和国引入的尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)种群基因组特征,包含213份尼罗罗非鱼样本(来自原生及引入区域)和48份其他罗非鱼物种样本的基因分型数据,通过RAD测序获得27611个SNP位点,可分析种群分化、遗传混杂及入侵后果。 文件详解 文件名称:README.docx 文件格式:DOCX...
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Walleye_Harvest_Associated_野生白斑狗鱼种群体型与基因组变化研究数据
数据集概述 本数据集记录了魁北克Mistassini湖三个捕捞种群及一个低捕捞参考种群15年间的体型、年龄及基因组变化,包含约9000个SNP位点的分析数据,结合原住民知识,揭示捕捞诱导的表型与遗传耦合变化,为渔业资源管理提供依据。 文件详解 VCF文件(2个) 文件名称:Bowles_et_al-...
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Pocillopora_Based_Indo_Pacific珊瑚多标准物种界定研究数据_2023
数据集概述 本数据集为Indo-Pacific海域Pocillopora珊瑚的物种界定研究数据,基于基因组学、形态学、生物地理学及共生生态学多标准展开。包含356个珊瑚群体的全基因组SNP数据、微形态测量数据、共生藻关联数据等,用于解析该属珊瑚系统发育、提出物种假说并验证多证据一致性,支持珊瑚分类修订与保护。 文件详解 基因组与遗传数据...
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stickleback_genome_Based_三刺鱼种群全基因组序列分析数据
数据集概述 本数据集包含81个三刺鱼全基因组序列分析结果,覆盖太平洋北美、格陵兰及北欧16个种群。通过核SNPs主成分分析、线粒体基因组序列分析及全基因组重组 coalescence 方法,揭示不同地理区域种群的分化特征、谱系混合模式及种群动态历史差异,为三刺鱼适应性进化研究提供基础数据。 文件详解 文件名称:mtDNA_alignments.zip...
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Patella_Based_Canary_Islands濒危帽贝遗传分化研究数据
数据集概述 本数据集为Canary Islands濒危帽贝Patella candei candei的遗传分化研究数据,包含SNP数据集及COX1序列分析输入文件,支持种群遗传结构、物种分类关系及保护单元划分的研究,共5份文件。 文件详解 README.txt 文件格式:TXT...
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Beacon_Training_Material_Beacon_V2教程训练数据
数据集概述 本数据集为Galaxy Training Material中“Working with Beacon V2”教程的训练数据,包含来自1000 Genomes Project和GDC数据库的5个文件,覆盖JSON、XLSX、VCF、TSV格式,用于指导用户学习Beacon V2的构建、数据转换、导入及变体查询技能,支撑教程中的实操练习。...
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RAD_Based_Alvord_Basin丘头鱼种群遗传结构与演化历史研究数据
数据集概述 本数据集为美国俄勒冈州东南部及内华达州北部Alvord Basin区域的Alvord丘头鱼与Borax Lake丘头鱼遗传结构研究数据,通过RAD测序技术获取遗传变异信息,分析种群遗传结构、物种间亲缘关系及演化历史,包含8个相关文件。 文件详解 数据文件 文件名称:Data1_batch_1.catalog.tags.tsv...
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Oregon_junco_Based_歌雀谱系分化基因组漂移与局部适应性研究数据
数据集概述 本数据集聚焦北美西部俄勒冈歌雀的快速谱系分化过程,包含基因组水平的SNP位点数据及环境变量数据,用于研究中性漂移与局部适应性在种群分化中的相对作用,涉及孤立干旱山区种群与湿润北部种群的遗传结构差异,支持遗传-环境关联分析。 文件详解 基因组变异数据文件(.vcf格式,共4个)...



