数据集 - 海数据

美国怀俄明州骡鹿景观基因组学与功能连通性数据集

2025年12月15日

数据集概述本数据集基于美国怀俄明州406头骡鹿的4051个单核苷酸多态性（SNP）标记，分析其遗传结构与环境变量的关联，识别影响基因流动的景观因素，揭示不同遗传群体功能连通性的区域差异，为迁徙物种保护提供依据。文件详解说明文档类： readme.txt：TXT格式，介绍数据集的文件清单及研究背景...

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鳟鱼取食形态快速适应高山湖泊环境数据集

2025年12月14日

数据集概述本数据集包含美国怀俄明州风河山脉高山湖泊中鳟鱼取食形态（如鳃耙特征）、遗传数据、湖泊环境变量及相关分析脚本，用于验证鳟鱼因捕食驱动的浮游动物群落变化而快速适应的生态进化过程。文件详解该数据集包含数据文件、分析脚本、文档等多种类型文件，具体说明如下： - 数据文件： -...

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硬粒小麦_Kronos_染色体水平基因组组装数据集

2025年12月13日

数据集概述本数据集包含硬粒小麦'Kronos'的染色体水平基因组组装及相关突变分析数据，含外显子捕获和启动子捕获测序的突变识别结果，采用MAPS流程分析并通过SnpEff预测变异效应，数据使用遵循多伦多协议的预发布共享原则。文件详解文件名称及格式： Kronos_v1.1_Exome-...

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多组学尿路上皮抗PDL1分析数据文件

2025年12月13日

数据集概述本数据集是用于支持多组学尿路上皮抗PDL1分析项目的数据文件集合，包含TCRS、Kallisto和VCFs三种类型的压缩数据文件，为相关生物信息学分析提供原始数据支持。文件详解文件名称: tcrs.zip 文件格式: ZIP (.zip) 内容说明: 可能包含T细胞受体（TCR）相关的测序或分析数据文件名称: kallisto.zip...

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白血病细胞系REH多组学表征数据集

2025年12月13日

数据集概述本数据集是关于白血病细胞系REH的多组学表征研究成果，包含通过短读长和长读长测序技术获得的基因组、转录组等多组学数据及分析结果，为深入研究REH细胞系的分子特征提供支持。文件详解覆盖深度分析文件:...

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北美东部及西弗吉尼亚州入侵植物忍冬种群结构研究数据集

2025年12月13日

数据集概述本数据集围绕入侵植物忍冬（Lonicera japonica）的种群结构展开，包含用于基因分析的SNP数据文件及相关研究图表，为探究北美东部及西弗吉尼亚州该入侵物种的种群特征提供数据支持。文件详解文件名称: Jh2_tassel_LD_thinned.vcf.recode.vcf 文件格式: VCF (.vcf) 内容说明:...

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斑马鱼实验室驯化遗传特征数据集

2025年12月12日

数据集概述该数据集通过RAD-seq技术对印度、尼泊尔、孟加拉国的野生斑马鱼种群及四种常见实验室品系进行遗传特征分析，对比野生种群与实验室品系的遗传多样性、杂合度等指标，揭示实验室驯化对斑马鱼遗传背景的影响。文件详解 wildlabdanio.vcf.gz：VCF压缩格式文件，包含野生斑马鱼种群及实验室品系的遗传变异数据...

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TAILVAR终止密码子分析与延长变体预测数据集

2025年12月12日

数据集概述该数据集包含TAILVAR评分开发的相关文件，TAILVAR评分用于评估终止密码子（TAA、TGA、TAG）处终止缺失变体的功能影响。TAILVAR基于随机森林模型预测终止缺失变体的致病性，整合多种预测评分、转录本特征和蛋白质上下文信息，输出0-1的致病性概率评分。文件详解...

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鸟类辐射进化基因组位点系统发育研究数据集

2025年12月12日

数据集概述本数据集围绕雀形目柳莺属8种鸟类的基因组系统发育研究展开，包含基因流对系统发育重建影响的分析数据，涵盖模拟输入、重组率估计、系统发育网络等多类型文件，为探究基因组数据与物种真实进化关系的差异提供支持。文件详解群体遗传学模拟输入文件：...

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叉角羚种群基因组学核心分布区连通性研究数据集

2025年12月11日

数据集概述该数据集包含美国怀俄明州398只叉角羚的基因组学研究数据，涵盖4949个全基因组单核苷酸多态性（SNP）和11个微卫星基因座的基因型信息，以及样本基础信息、生物信息学分析流程文件等，用于评估叉角羚核心分布区的遗传结构与基因流状况。文件详解该数据集包含17个文件，按类型分组说明如下： - 文档与协议文件 -...

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山地苔草物种系统地理相似性协方差的物种分化轴测试数据集

2025年12月11日

数据集概述该数据集围绕四种落基山脉苔草物种（Carex属）的系统地理模式展开，通过对比物种的分布范围大小与生态位宽度两个属性，探究其对遗传变异空间结构的影响，揭示了分布范围大小与物种间空间遗传协变的相关性。文件详解核心数据文件: chalciolepis_97_30maf2_unlinked.vcf:...

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鹰嘴豆干旱耐受性及相关农艺性状全基因组关联研究数据集

2025年12月11日

数据集概述本数据集基于全基因组关联研究（GWAS），探究鹰嘴豆干旱耐受性及相关农艺性状的遗传标记。包含185份鹰嘴豆材料在黎巴嫩两地两年间灌溉与雨养环境下的表型数据、SNP基因分型数据及关联分析结果，为鹰嘴豆抗旱育种提供遗传依据。文件详解表型数据文件：...

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Viridian共识序列与元数据2024_10_14

2025年12月9日

数据集概述该数据集是对Viridian SARS-CoV-2数据集的重新打包，包含2024年10月14日批次1和批次2的共识序列与元数据。通过MAFFT对齐至武汉参考序列，并转换为VCF Zarr格式，以单个压缩包提供紧凑易访问的数据。文件详解文件名称：viridian_mafft_2024-10-14_v1.vcz.zip...

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濒危德尔马熊果保护遗传学RAD测序数据集

2025年12月9日

数据集概述本数据集围绕濒危物种德尔马熊果（Arctostaphylos glandulosa supsp. crassifolia）的保护遗传学研究，通过RAD测序技术获取SNP数据，分析其与近缘亚种的遗传关系，旨在验证形态学分类是否反映真实遗传模式，为保护规划提供依据。文件详解 VCF格式数据文件（共3个）：...

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果蝇对新型实验室环境适应性的选择等位基因轨迹数据集

2025年12月9日

数据集概述该数据集记录了黑腹果蝇在新型实验室环境下的适应性进化过程，通过实验进化与Pool-Seq全基因组测序技术，识别了5000余个偏离中性预期的选择等位基因（SNP），并追踪其异质性进化轨迹（持续上升或先升后稳），为进化生物学中环境适应的基因组机制研究提供数据支持。文件详解文档类文件： Description of Bioinformatic...

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北极海鸟象牙鸥种群数量下降的遗传证据研究数据集

2025年12月7日

数据集概述本数据集为探究北极海鸟象牙鸥种群数量下降遗传证据的研究数据，包含遗传分析相关的原始数据、处理文件及说明文档，覆盖全球部分分布区域的样本，为检验象牙鸥近期种群瓶颈遗传信号提供数据支持。文件详解 README.pdf：PDF格式，研究说明文档，可能包含数据集背景、实验设计及使用说明等内容...

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同源导入小鼠线粒体DNA谱分析处理数据文件

2025年12月6日

数据集概述本数据集包含同源导入小鼠线粒体DNA谱分析项目中所有使用和生成的处理数据文件，涵盖变异数据、频率统计、深度数据等关键分析结果，通过配套PDF文档提供文件和字段说明，为线粒体DNA变异与功能研究提供结构化数据支持。文件详解核心分析文件（包含于压缩包中）： somatic_mutations.vcf：VCF格式，体细胞变异数据文件...

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网纹怀俄明菊_菊科_保护基因组学数据集

2025年12月6日

数据集概述该数据集为网纹怀俄明菊的保护基因组学研究数据，包含168个样本的高分辨率基因组信息，样本来自加州埃尔多拉多县派恩山地区的7个已知种群中心，用于分析无性繁殖频率、种群遗传变异及遗传模式的生态关联。文件详解文档文件（PDF格式）： Appendix_S7.pdf：可能包含研究附录或补充材料...