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Helianthus_Based向日葵种群基因组学与蛋白质进化决定因素研究数据
数据集概述 本数据集来源于向日葵种群基因组学与蛋白质进化研究，基于RNAseq技术分析野生向日葵（Helianthus spp.）的基因组变异与蛋白质进化机制。包含转录组参考序列、原始读段计数及SNP位点表格三类文件，可用于研究种群聚类、适应性替换比例、基因本体分类及蛋白质进化速率相关的基因组因素关联分析。 文件详解 原始读段计数文件...
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Arabidobsis_Super50_2020_RNAseq_抗逆性研究数据
数据集概述 本数据集包含拟南芥（Arabidopsis thaliana）在SuperFifty（SF）预处理后对百草枯（PQ）诱导的氧化胁迫响应的转录组、代谢组和脂质组分析数据。研究显示SF预处理可预防PQ引起的坏死损伤，通过多组学分析揭示SF调控的基因表达、代谢物积累及脂质变化，为植物抗逆机制研究提供数据支持。 文件详解...
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Wang_Lab_RNAseq_Additional_Data_Repository
数据集概述 本数据集为Wang Lab的RNAseq分析附加数据仓库，包含13个文件，主要用于支持论文“Chromosome Architecture Impact Virulence and Competitiveness in Agrobacterium tumefaciens...
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Hewitt_Dryad_Based_子宫内膜与上皮类器官ESR1顺反组研究补充材料
数据集概述 本数据集为子宫内膜雌激素受体α（ESR1）顺反组研究的补充材料，包含月经周期不同阶段子宫内膜活检样本及激素刺激上皮类器官的ESR1结合位点（ChIPseq）与基因表达（RNAseq）整合分析结果，涉及周期特异性ESR1靶基因推断及子宫内膜与类器官的响应差异比较。 文件详解 README_Hewitt_Dryad.docx 文件格式：DOCX...
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Arabidopsis_thaliana_Based_拟南芥重复基因可变剪接转录组分析数据
数据集概述 本数据集基于拟南芥RNA-seq数据，研究基因重复事件后可变剪接模式在重复基因间的保守性与分化程度。包含全基因组重复（alpha）和串联重复基因的可变剪接事件定性、定量分化情况，以及可变剪接诱导的无义介导降解（NMD）分化分析结果，共2个文件。 文件详解 README_for_Github_Dryad_repo.md 文件格式：MD...
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APOE_Alzheimer_s_disease_model_小胶质细胞转录组表观组补充数据
数据集概述 本数据集为论文的补充数据，聚焦APOE亚型对阿尔茨海默病异种移植模型中人类小胶质细胞转录组和表观组特征的影响。包含七份文件，涵盖RNA-seq与ATAC-seq质量控制、差异表达基因、基因集分析、差异可及性区域、遗传力分析、通路富集及基序富集等结果，支撑APOE亚型相关分子机制研究。 文件详解...
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Chenopodium_quinoa_Based_藜麦光周期与发育响应转录组数据
数据集概述 本数据集记录藜麦（Chenopodium quinoa Willd.）叶与茎尖分生组织在光周期和发育过程中的转录组信息，包含光周期敏感与不敏感材料的基因表达差异，涉及222个光周期响应叶基因、1812个长日条件下材料差异叶基因、57个短日条件下发育响应叶基因及911个茎尖分生组织成花转变响应基因，可用于藜麦开花时间调控机制研究。 文件详解...
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GWAS_RNA_seq_Based_绵羊遗传性交界性表皮松解症致病突变研究数据
数据集概述 本数据集为绵羊遗传性交界性表皮松解症（JEB）致病突变研究的关联分析文件。研究通过GWAS定位JEB位点至绵羊11号染色体，结合RNA-seq发现ITGB4基因外显子33的4bp缺失突变，证实其为致病原因。数据集包含关联分析相关文件，支持绵羊JEB遗传机制研究与育种应用。 文件详解...
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Lohman_Evaluation_of_TagSeq_转录组测序方法对比评估数据
数据集概述 本数据集围绕TagSeq这一低成本RNAseq替代方法展开，对比其与“金标准”NEBNext®全mRNAseq方法的性能。通过对相同生物样本构建两种文库并加入对照RNA，评估TagSeq在基因表达定量准确性、成本效益及技术重复性等方面的表现，为生态遗传学等领域提供经济高效的转录组研究方案参考。 文件详解 文件名称：Lohman et al...
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Clonal_Heterogeneity_乳腺癌内分泌治疗耐药性克隆异质性研究数据
数据集概述 本数据集围绕乳腺癌内分泌治疗耐药性的克隆异质性展开，通过对敏感细胞系（MCF7、T47D）进行条形码标记并诱导耐药，分离单克隆细胞系后开展RNA-Seq和磷酸化蛋白质组学分析。包含8个文件，涵盖条形码标记信息、基因表达数据及整合位点分析等内容，用于研究耐药克隆的分子特征。 文件详解 文本文件（TXT） 文件名称：Supplementary...
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LKRSDH_Histone_Modifications_昼夜节律年龄变化研究数据
数据集概述 本数据集包含论文《LKRSDH-dependent histone modifications of insulin-like peptide sites contribute to age-related circadian rhythm changes》的相关数据与脚本，涉及RNA-seq、CHIP-...
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Acute_stress_Based_人类急性应激下RNA剪接与蛋白质分泌研究补充数据
数据集概述 本数据集是论文《Acute stress triggers RNA splicing and protein secretion in...
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RNAseq_Based_MCMV感染后唾液腺IL10阳性与阴性CD4_T细胞转录组数据
数据集概述 本数据集为MCMV感染后第14天，唾液腺中IL10阳性与IL10阴性CD4+ T细胞的Bulk RNAseq差异分析结果。通过DESeq2工具处理，呈现两组细胞的基因表达差异数据，为研究病毒感染后免疫细胞功能调控提供转录组层面的参考。 文件详解 文件名称：pos_vs_neg.all.featurecount.annotated.xlsx...
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Taraxacum_officinale_茉莉酸处理_蒲公英代际环境效应_转录组代谢组数据
数据集概述 本数据集聚焦无融合生殖蒲公英（Taraxacum officinale）的代际环境效应，通过亲代茉莉酸（JA）处理实验，分析子代转录组与代谢组的功能信号。采用亲代与子代JA及对照处理的全因子交叉设计，包含叶片RNA-seq基因表达、LC-MS代谢组学及总酚含量测定数据，揭示亲代环境对后代表型的影响机制。 文件详解...
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Developmental_transcriptomics_熊蜂拟态颜色变异基因网络研究数据
数据集概述 本数据集聚焦熊蜂拟态颜色变异的遗传机制研究，通过组织/阶段特异性转录组分析及qRT-PCR验证，揭示Hox基因Abd-B下游调控颜色模式分化的基因网络，包括中间发育基因、黑色素与氧化还原相关基因等，涉及昆虫褐黑素合成相关潜在基因，为理解熊蜂颜色模式发育及适应性表型辐射提供数据支持。 文件详解...
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Transcriptomic_Response_Based_蚁后繁殖与免疫响应转录组研究数据
数据集概述 本数据集围绕蚁后繁殖与长寿的生理权衡展开，通过损伤处理增加免疫成本，测量产卵率变化及全基因组基因表达差异，验证蚁后繁殖与免疫响应的资源分配关系。包含产卵率、转录组测序及跨物种比较数据，共4个文件。 文件详解 产卵率数据文件 文件名称：Fecundity.xlsx 文件格式：XLSX...
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CapitalBio_SARS_CoV_2_PanH1N1_H7N9感染细胞RNA_seq数据
数据集概述 本数据集包含SARS-CoV-2、panH1N1、H7N9三种病毒感染A549细胞后的RNA测序数据，涵盖mRNA、circRNA、miRNA、LNC等不同RNA类型，共12个Excel文件，记录了病毒感染60小时后细胞的基因表达情况。 文件详解 数据文件（共12个，均为xlsx格式） SARS-CoV-2感染相关：circ-SARS-...
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GRF_interacting_factor1_Based_玉米株型与分生组织确定性调控研究数据
数据集概述 本数据集为玉米（Zea mays）生长调节因子相互作用因子1（gif1）基因功能研究的补充数据，涉及株型结构、分生组织确定性调控机制相关实验结果，包括基因互作、差异表达基因及染色质免疫沉淀分析等关键数据，支持解析gif1基因对玉米生长发育的调控作用。 文件详解 文件名称：Supplemental Data Set 1.xlsx...
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Transcriptional_profiling_哺乳动物饥饿与增肥响应_自噬基因转录调控数据
数据集概述 本数据集基于饥饿（营养剥夺）和增肥（高脂饮食）条件下的转录组分析，揭示哺乳动物自噬基因的差异调控机制。通过网络算法识别饥饿响应相关的基因子网络，包含Jun、Fos、ATF家族转录因子及ULK1等自噬体基因模块，并在小鼠脑、肝、肌肉组织中验证。数据集含4个文件，为自噬基因调控研究提供资源。 文件详解 README.md 文件格式：MD...
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Dryad_Bivalvia_Phylogenetic_Backbone_RNA_seq_研究数据
数据集概述 本数据集为双壳类（Bivalvia）系统发育研究的RNA-seq数据，包含31种双壳类的转录组数据及已发表基因组、转录组数据。通过系统发育基因组学分析，构建了双壳类可靠的系统发育框架，解决了原鳃亚纲、异齿亚纲等类群的单系性及古异齿亚纲等类群的系统位置问题，可支持宏观进化理论验证。 文件详解 文档文件...
